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基于不同靶基因的3种住肉孢子虫PCR检测方法比较

基于不同靶基因的3种住肉孢子虫PCR检测方法比较

作     者:孙滔 米荣升 张烨华 张世杰 张晓丽 贾海燕 曾江勇 黄燕 龚海燕 韩先干 陈兆国 赵权 SUN Tao;MI Rong-sheng;ZHANG Ye-hua;ZHANG Shi-jie;ZHANG Xiao-li;JIA Hai-yan;ZENG Jiang-yong;HUANG Yan;GONG Hai-yan;HAN Xian-gan;CHEN Zhao-guo;ZHAO Quan

作者机构:吉林农业大学动物科学技术学院吉林长春130118 中国农业科学院上海兽医研究所上海200241 农业农村部动物产品质量安全生物性危害因子风险评估实验室(上海)上海200241 农业农村部动物寄生虫学重点实验室上海200241 西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所西藏拉萨850009 

基  金:国家重点研发计划项目(2018YFD0502305) 上海市科技兴农项目(2019-02-08-00-08-F01151) 国家农产品质量安全风险评估项目(GJFP2019022) 中央级公益性科研院所基本科研业务费项目(2019JB13) 

出 版 物:《动物医学进展》 (Progress In Veterinary Medicine)

年 卷 期:2020年第41卷第12期

页      码:1-6页

摘      要:为筛选敏感、特异的住肉孢子虫(Sarcocystis spp.)PCR检测方法,对以住肉孢子虫18S rRNA、28S rRNA和线粒体细胞色素C氧化酶I基因(cox 1)的部分片段为靶基因设计的3套引物建立的PCR方法进行敏感性和特异性试验,并对田间采集的100份牛源和猪源肌肉样品进行检测。结果显示,以18S rRNA和28S rRNA为靶基因的PCR检测方法的敏感性相似,DNA最小检出量均为1×10-2 ng/μL;而以cox 1为靶基因的PCR检测方法敏感性相对较低,DNA的最低检出量为1 ng/μL。对7种不同寄生虫DNA进行特异性试验,结果以cox 1基因为靶基因的PCR方法特异性较好,仅能够扩增出枯氏住肉孢子虫(Sarcocystis cruzi)DNA;以18S rRNA为靶基因的PCR法,除枯氏住肉孢子虫外,刚地弓形虫和微小隐孢子虫也有相似扩增条带;以28S rRNA为靶基因的PCR法,除枯氏住肉孢子虫外,刚地弓形虫、微小隐孢子虫和欧猥迭宫绦虫DNA也能扩增出杂带,但大小不符。利用3种方法对100份牦牛和猪肉样品进行扩增,发现以18S rRNA、28S rRNA和cox 1为靶基因的PCR法的阳性率分别为36.00%(36/100)、43.00%(43/100)和38.00%(38/100)。结果表明,以cox 1为靶基因的PCR法有良好的特异性,适合用于田间动物肌肉样品中住肉孢子虫的检测,为开展动物住肉孢子虫病分子流行病学及防控研究提供了依据。

主 题 词:18S rRNA基因 28S rRNA基因 cox 1基因 PCR方法 住肉孢子虫 

学科分类:090601[090601] 090602[090602] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

D O I:10.16437/j.cnki.1007-5038.2020.12.001

馆 藏 号:203100054...

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