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基于HPPK靶标酶的分子对接研究——金属离子Mg^(2+)的影响

基于HPPK靶标酶的分子对接研究——金属离子Mg^(2+)的影响

作     者:赵文娜 邹建卫 蒋勇军 马国正 俞庆森 ZHAO Wen-Na;ZOU Jian-Wei;JIANG Yong-Jun;MA Guo-Zheng;YU Qing-Sen

作者机构:浙江大学宁波理工学院分子设计与营养工程市重点实验室宁波315100 

基  金:国家自然科学基金(No.20173050)资助项目 

出 版 物:《化学学报》 (Acta Chimica Sinica)

年 卷 期:2005年第63卷第5期

页      码:434-438页

摘      要:6-羟甲基-7,8-二氢喋呤磷酸化酶(HPPK)催化细菌进行叶酸合成反应中的第一步,即焦磷酰从三磷酸酰酐(ATP)转移到6-羟甲基-7,8-二氢喋呤(HP),被认为是基于结构虚拟筛选新型抗生素的理想靶标.本工作分别以HPPK和含有金属离子Mg2+的HPPK为受体,以底物类似物为配体进行了对接,发现活性口袋大小、金属镁离子对对接结果有较大的影响.特别是金属镁离子的加入不仅可大大提高对接结果的可信度,同时可增加虚拟筛选的命中率.这一结果将为设计新的HPPK抑制剂提供一定的理论指导.

主 题 词:虚拟筛选 Mg^2+ 影响 叶酸 受体 新型抗生素 配体 羟甲基 合成反应 磷酸 

学科分类:1007[医学-药学类] 100705[100705] 0703[理学-化学类] 10[医学] 

核心收录:

D O I:10.3321/j.issn:0567-7351.2005.05.016

馆 藏 号:203100235...

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