基于RefSeq的人类基因荧光定量PCR引物库的构建

作     者：周贵良 洪来法 梁敏玲 郑柳城 陈转贤 ZHOU Gui-liang;HONG Lai-fa;LIANG Min-ling;ZHENG Liu-cheng;CHEN Zhuan-xian

作者机构：广州复能基因有限公司广州510663 

基　　金：863计划项目(2006AA020903) 

出 版 物：《生物信息学》 (Chinese Journal of Bioinformatics)

年 卷 期：2010年第8卷第2期

页      码：139-141页

摘      要：利用NCBI提供的RefSeq序列,通过BLAT、Sim4和自主开发的剪接比对程序Ealter1.0对人类RefSeq转录本进行外显子预测,根据预测的外显子信息,采用自主开发SYBR Green I Real Time PCR引物设计程序E-qPCR-Design1.0高通量设计21,118对SYBR Green I Real Time PCR引物,同时选取5000条基因进行SYBR Green I Real Time PCR引物验证,95.92%的基因引物取得良好效果,1.64%的基因引物产生引物二聚体,1.08%的基因引物有非特异性扩增,通过生物信息技术分析与实验验证,建立了基于RefSeq的人类基因荧光定量PCR引物库。

主 题 词：RefSeq转录本数据库 实时定量PCR 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 071010[071010] 081704[081704] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-轻工类] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1672-5565.2010.02.010

馆 藏 号：203100393...