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白皮黄瓜鲨烯合酶基因cDNA克隆及生物信息学分析

白皮黄瓜鲨烯合酶基因cDNA克隆及生物信息学分析

作     者:马成通 钱洁颖 刘镛 陶晨陈 苏荷玲 晁耐霞 吴耀生 Ma Chengtong;Qian Jieying;Liu Yong;Tao Chenchen;Su Heling;Chao Naixia;Wu Yaosheng

作者机构:广西医科大学生物化学与分子生物学教研室南宁530021 广西高校生物分子医学研究重点实验室南宁530021 广东医学院药学院东莞523808 桂林医学院桂林541004 

基  金:国家自然科学基金(No.31260069) 广西高等学校科研项目(No.201203YB038)共同资助 

出 版 物:《基因组学与应用生物学》 (Genomics and Applied Biology)

年 卷 期:2016年第35卷第1期

页      码:183-189页

摘      要:为认识葫芦科植物中葫芦素生物合成途径所需鲨烯合酶基因结构特征,克隆白皮黄瓜鲨烯合酶(squalene synthase,SS)基因c DNA并进行生物信息学分析。根据葫芦科植物绞股蓝、罗汉果、红花栝楼等的鲨烯合酶基因cDNA序列,设计白皮黄瓜鲨烯合酶引物,分别采用3 RACE和5 RACE技术扩增鲨烯合酶基因3 端和5 端。获得白皮黄瓜鲨烯合酶基因的两个cDNA克隆,命名为CsSS1和CsSS2,其cDNA序列全长分别为1 627 bp和1 534 bp,都编码417个氨基酸残基,分子质量为47.6 k D。成功克隆得到白皮黄瓜鲨烯合酶基因全长cDNA序列并对其进行序列分析,后续可用于葫芦素生物合成途径所需鲨烯合酶基因正选择位点功能分析。

主 题 词:白皮黄瓜 鲨烯合酶 RACE 基因克隆 生物信息学分析 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 090102[090102] 

核心收录:

D O I:10.13417/j.gab.035.000183

馆 藏 号:203101308...

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