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菊花ClERF1基因的克隆与表达分析

菊花ClERF1基因的克隆与表达分析

作     者:任镘蓉 全英杰 岳圆圆 杨文婷 何子涵 高日 REN Manrong;QUAN Yingjie;YUE Yuanyuan;YANG Wenting;HE Zihan;GAO Ri

作者机构:延边大学农学院吉林延吉133002 

基  金:国家自然科学基金地区科学基金资助项目(32060696) 吉林省“十三五”科学技术资助项目(JJKH20180902KJ) 延边大学青年基金资助项目(延大科合字(2017)第21号) 延边大学博士科研启动基金资助项目(602018027) 农业农村部景观设计重点实验室开放课题资助项目(KF201902) 

出 版 物:《北方园艺》 (Northern Horticulture)

年 卷 期:2021年第1期

页      码:66-72页

摘      要:以甘菊叶片为试验材料,采用RT-PCR和Tail-PCR以及生物信息学的方法,研究了甘菊ClERF1及其启动子序列特征、表达模式,以及甘菊ClERF1在低温胁迫下的响应。以期为进一步研究甘菊ClERF1功能提供参考依据。结果表明:ClERF1基因序列全长1 242 bp,最大开放阅读框(ORF)618 bp,可编码206个氨基酸。经理化性质分析,ClERF1分子量23 631.35 Da,理论等电点5.19,不稳定系数53.84,脂肪指数62.04,平均亲水性-0.786,亚细胞定位在细胞核内。系统进化树表明,ClERF1与拟南芥At3g23240亲缘关系最近,属于ERF亚家族。qRT-PCR分析表明ClERF1在叶片中表达最高,其次在茎段中。该研究克隆了ClERF1启动子序列1 534 bp,主要包括低温反应和乙烯响应元件、生长素和茉莉酸甲酯反应元件等。甘菊低温处理幼苗ClERF1表达量显著高于未低温处理的幼苗,其中5℃时ClERF1相对表达量最高。

主 题 词:菊花 AP2/ERF 基因克隆 启动子元件 

学科分类:07[理学] 0713[0713] 

D O I:10.11937/bfyy.20200582

馆 藏 号:203101545...

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