应用基因芯片技术检测结核分枝杆菌耐异烟肼基因型

作     者：张俊仙 吴雪琼 邢婉丽 梁艳 阳幼荣 李洪敏 ZHANG Jun-xian;WU Xue-qiong;XING Wan-li;LIANG Yan;YANG You-rong;LI Hong-min

作者机构：解放军总医院第二附属医院结核病研究室北京100091 生物芯片北京国家工程研究中心北京102206 

基　　金："十五"国家重大科技专项"功能基因组和生物芯片"科研基金 军队医学杰出中青年人才科研基金项目(01J020) 

出 版 物：《河北医科大学学报》 (Journal of Hebei Medical University)

年 卷 期：2008年第29卷第4期

页      码：491-494页

摘      要：目的研制一种新型DNA芯片,用于快速检测结核分枝杆菌耐异烟肼katG基因突变。方法根据结核分枝杆菌katG基因序列设计探针并制作DNA芯片,用四甲基罗丹明标记的引物扩增结核分枝杆菌katG基因突变热点的片断,与DNA芯片杂交,同时以聚合酶链反应-单链构象多态性(pdymerase chain reaction-single stranded conformation polymorphism,PCR-SSCP)和DNA测序法为对照。结果153株结核分枝杆菌临床分离株中30株异烟肼敏感株的PCR-SSCP和DNA芯片杂交结果与结核分枝杆菌标准株完全相同,123株异烟肼耐药株中有85株检测到katG基因突变,占69.1%(85/123)。其中83株为315位密码子AGC→ACC突变,2株为315位密码子AGC→AAC突变,该突变与PCR-SSCP和DNA芯片杂交结果一致;余38株未检测到突变,经测序证实其中1株PCR-SSCP有不同突变的为279位密码子GGC→GAC突变,因芯片上未点该位点的探针,所以杂交结果为阴性。结论用DNA芯片可快速、特异地检测出大多数结核分枝杆菌耐异烟肼分离株的katG基因突变,可用于临床耐药性的检测,指导临床用药。

主 题 词：分枝杆菌,结核 异烟肼 药物耐受性 

学科分类：1007[医学-药学类] 100705[100705] 1001[医学-基础医学] 100103[100103] 10[医学] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1007-3205.2008.04.003

馆 藏 号：203101764...