猪Nrf2基因克隆、表达及序列特征分析

作     者：徐秋良 周康康 李君 刘永祥 朱宽佑 肖锦红 Xu Qiuliang;Zhou Kangkang;Li Jun;Liu Yongxiang;Zhu Kuanyou;Xiao Jinhong

作者机构：河南牧业经济学院动物科技学院郑州450046 西北农林科技大学动物科技学院杨凌712100 

基　　金：国家自然科学基金项目(31601915) 河南省科技攻关项目(162102110040)共同资助 

出 版 物：《基因组学与应用生物学》 (Genomics and Applied Biology)

年 卷 期：2020年第39卷第10期

页      码：4409-4416页

摘      要：Nrf2是细胞抗氧化体系Keap1-Nrf2/ARE中的关键转录因子。本研究以杜长大仔猪肝脏总RNA为材料,根据GenBank公布的人、牛和大鼠Nrf2序列设计引物,利用RT-PCR法克隆猪Nrf2基因的全编码序列,并通过生物信息学分析预测该基因的结构和系统发育;采用qRT-PCR技术检测Nrf2基因在仔猪不同生理阶段和不同组织中的表达情况。结果表明:猪Nrf2基因包含1个1776 bp的开放阅读框,编码591个氨基酸。生物信息学分析显示,猪Nrf2蛋白含3个特征结构域,与牛Nrf2的氨基酸序列相似性最高,为88.45%,而与褶纹冠蚌相似度最低,为30.64%。qRT-PCR结果显示,Nrf2在本实验所检测的组织中均有表达,其中以背最长肌表达量最高,显著高于其他组织(p<0.05);心脏和肾脏次之,小肠和肝脏表达较少;肺脏和脾脏表达丰度最低;Nrf2在初生、断奶、35日龄、70日龄和100日龄猪的背最长肌中均有表达,以断奶阶段表达量最高(p<0.05),100日龄表达量最低(p<0.05)。本研究为进一步探讨猪Nrf2基因的生物学功能提供了理论依据。

主 题 词：猪 核因子E2 相关因子2 基因(Nrf2) 生物信息学分析 组织表达 

学科分类：0905[农学-林学类] 09[农学] 

核心收录：

D　O　I：10.13417/j.gab.039.004409

馆 藏 号：203102112...