欧李ChIRT1基因的克隆与生物信息学分析

作     者：林琳 张雪萌 郝梦琪 郭东林 Lin Lin Zhang;Xuemeng Hao;Mengqi Guo;Donglin

作者机构：哈尔滨师范大学生命科学与技术学院黑龙江省分子遗传与遗传育种重点实验室哈尔滨150025 

基　　金：国家转基因生物新品种培育重大专项(2016ZX08004-002) 林木遗传育种国家重点实验室(东北林业大学)开放基金 哈尔滨市科技局青年后备人才项目(2017RAQXJ048)共同资助 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2021年第19卷第3期

页      码：808-814页

摘      要：欧李(Cerasus humilis)是蔷薇科矮生灌木,果实中的钙、铁等营养物质丰富。铁调转运基因1(IRT1)编码的蛋白是ZIP金属转运家族中主要的铁转运蛋白,负责植物中金属离子的转运,尤其是铁的吸收。本研究从欧李叶片中提取RNA,逆转录得到cDNA;参照小金海棠(Malus xiaojinensis)MxIRT1基因设计引物;克隆了欧李ChIRT1基因,并进行了生物信息学分析。结果表明,ChIRT1全长1417 bp,含有1个678 bp的开放阅读框,编码226个氨基酸。推测ChIRT1蛋白的分子量约为24 kD,理论等电点为7.72,含有4个跨膜结构域,属于跨膜蛋白。ChIRT1含有一个ZIP结构域,二级结构中α-螺旋占44.69%,无规则卷曲占38.94%。系统发育分析表明,欧李的ChIRT1基因与蔷薇科的IRT1基因关系密切,与樱桃李(Prunus persica)的PpIRT1基因相似度最高。本研究克隆了欧李ChIRT1基因,并分析了其序列特征,为研究欧李ChIRT1基因功能及铁调节机制提供了依据。

主 题 词：欧李(Cerasus humilis) IRT基因 基因克隆 生物信息学分析 

学科分类：09[农学] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090201[090201] 

D　O　I：10.13271/j.mpb.019.000808

馆 藏 号：203102223...