慈竹4CL基因的克隆及其生物信息学分析

作     者：胡尚连 曹颖 黄胜雄 孙霞 卢学琴 蒋瑶 HU Shang-lian;CAO Ying;HUANG Sheng-xiong;SUN Xia;LU Xue-qin;JIANG Yao

作者机构：西南科技大学生命科学与工程学院四川绵阳621010 

基　　金：四川省应用基础研究基金资助项目(05JY029-101) 四川省教育厅项目(2003031022) 四川省青年基金资助项目(041100) 西南科技大学重点项目(2006031030) 

出 版 物：《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 (Journal of Northwest A&F University(Natural Science Edition))

年 卷 期：2009年第37卷第8期

页      码：204-210页

摘      要：【目的】克隆慈竹木质素生物合成酶4CL基因,研究其序列特征,为今后利用该基因调控慈竹木质素的生物合成研究奠定基础。【方法】参照其他物种4CL基因保守区,设计简并引物,以慈竹幼笋cDNA为模板,克隆到1条750 bp的4CL基因保守区片段。以这条保守区片段为模板,结合5′RACE和3′RACE克隆4CL基因全长序列,并对其进行了生物信息学分析。【结果】成功克隆了慈竹4CL基因全序列,该序列CDS区全长为1 674 bp,编码558个氨基酸;氨基酸序列中存在两大4CL氨基酸保守域(SSGTTGMPKGV和GEICIRG),其中前一个氨基酸保守域的第7个氨基酸位点变为M,与常见的L不同,表明慈竹的4CL基因发生了一定变异。系统进化分析表明,该基因(Na4CL)与水稻的Os4CL4和黑麦草的Lp4CL2具有很高的同源性。【结论】克隆了慈竹木质素合成酶4CL基因全长序列,在GenBank上注册为EU327341,可能与慈竹木质素生物合成有关。

主 题 词：慈竹 4CL基因 克隆 生物信息学分析 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 0907[农学-草药学] 07[理学] 08[工学] 0829[工学-安全科学与工程类] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

核心收录：

D　O　I：10.13207/j.cnki.jnwafu.2009.08.020

馆 藏 号：203102375...