编码酿酒酵母丙酮酸脱羧酶(Pdc6)基因克隆及其生物信息学分析

作     者：王长丽 廖巍 叶广彬 葛菁萍 刘磊 马毓坚 黄霞 宾晓芸 Wang Changli;Liao Wei;Ye Guangbin;Ge Jingping;Liu Lei;Ma Yujian;Huang Xia;Bin Xiaoyun

作者机构：右江民族医学院广西百色533000 黑龙江大学生命科学学院微生物省高校重点实验室哈尔滨150080 农业微生物技术教育部工程研究中心哈尔滨150500 

基　　金：国家自然科学基金“从2,3-丁二醇代谢角度构建工程微生物群体及其生态学机制究”(31570492) 广西自然科学基金“广西仫佬族人群骨密度与瘦素受体基因多态性的相关性研究”(2017JJA10377) 广西高校中青年教师基础能力提升项目“乳酸菌胞外多糖的结构表征及其抗肿瘤活性研究”(2020KY13007) 右江民族医学院2019年度校级科研课题“鸡黏膜免疫中CpG ODN最优类型和剂量的确定及其机制初探”(yy2019ky013) 

出 版 物：《中国农学通报》 (Chinese Agricultural Science Bulletin)

年 卷 期：2021年第37卷第9期

页      码：103-108页

摘      要：旨在从生物信息学角度更好地研究酿酒酵母丙酮酸脱羧酶(Pdc6)的结构和功能,克隆酿酒酵母H5的丙酮酸脱羧酶基因pdc6。利用Primer 5.0软件设计1对20 bp引物,以H5基因组DNA为模板克隆获得pdc6,并利用生物信息学分析方法对其序列进行验证及分析。该序列长度为1692 bp,无碱基缺失,且该基因具有完整的开放阅读框,该基因编码的Pdc6包含563个氨基酸残基,该蛋白质中酸性氨基酸残基数量和碱性氨基酸残基数量大致相同;Pdc6理论等电点5.8,疏水性最大值为2.32,亚细胞定位预测其位于细胞外基质,属于酸性蛋白质,并预测了空间结构模型。本研究说明该蛋白结构与Pdc1和Pdc5结构类似,对酿酒酵母H5编码丙酮酸脱羧酶(Pdc6)基因序列克隆和生物信息学分析后,可为后续单基因敲除选取基因顺序的研究提供一定的理论基础。

主 题 词：酿酒酵母 生物信息学分析 克隆 丙酮酸脱羧酶基因 开放阅读框 

学科分类：080702[080702] 08[工学] 0807[工学-电子信息类] 09[农学] 0903[农学-动物生产类] 

馆 藏 号：203102595...