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硝普钠(SNP)和茉莉酸甲酯(MeJA)诱导的白桦Ty1-copia类逆转座子的克隆及分析

硝普钠(SNP)和茉莉酸甲酯(MeJA)诱导的白桦Ty1-copia类逆转座子的克隆及分析

作     者:梁楠松 曾凡锁 李博 郭梁 詹亚光 Liang Nansong;Zeng Fansuo;Li Bo;Guo Li-ang;Zhan Yaguang

作者机构:东北林业大学哈尔滨150040 

基  金:国家自然科学基金(31070531) 黑龙江省高校青年学术骨干计划项目(1155G08) 

出 版 物:《东北林业大学学报》 (Journal of Northeast Forestry University)

年 卷 期:2013年第41卷第10期

页      码:69-74页

摘      要:利用Tvl—copia类逆转座子逆转录酶(RT)的保守区域设计引物,优化了扩增条件后利用RT—PCR从白桦愈伤组织中得到了1条逆转录酶序列。利用硝普钠(SNP)和茉莉酸甲酯(MeJA)诱导后分别扩增克隆了11条和9条逆转录酶序列。这2l条逆转录酶序列(命名Bprtl-21)变化范围为205—290bp,一致性为71.93%,异质性为1.1%。50.9%,翻译成氨基酸的异质性为0~57.1%。经SNP和MeJA处理的样品中,获得的逆转录酶序列基本是分别聚类.初步证明不同的Tvl-copia类逆转座子能够分别响应不同的信号而被转录激活。分析所获得的21逆转录酶序列和苹果中19务逆转录转座子序列(DQ410748-DQ410766)进化关系发现.逆转录酶基本各自聚类。但是Bprt9、Bprtll和OQ4m750进化关系比较接近,Bprt15、Bprt19、DQ410751和DQ410753聚为一类,证明逆转座子存在水平传递。

主 题 词:白桦 Tyl-copia类逆转座子 逆转录酶 转录活性 系统进化 异质性 简并杂交寡核苷酸引物 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

核心收录:

D O I:10.3969/j.issn.1000-5382.2013.10.015

馆 藏 号:203102738...

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