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牦牛CAPN1基因部分序列的SNPs研究

牦牛CAPN1基因部分序列的SNPs研究

作     者:吴孝杰 杨联 张利平 吴建平 万红玲 王建华 刘晓敏 王磊 WU Xiao-jie;YANG Lian;ZHANG Li-ping;WU Jian-ping;WAN Hong-ling;WANG Jian-hua;LIU Xiao-min;WANG Lei

作者机构:甘肃农业大学动物科学技术学院甘肃兰州730070 

基  金:甘肃省教育厅科学技术研究项目(0502-01) 甘肃省生物技术专项(GNSW-2009-08) 

出 版 物:《甘肃农业大学学报》 (Journal of Gansu Agricultural University)

年 卷 期:2010年第45卷第4期

页      码:28-32页

摘      要:本研究采用PCR-SSCP技术,设计了2对引物分别对牦牛钙激活蛋白酶基因内含子8、外显子9、内含子9和外显子10部分序列以及第12内含子和13外显子部分序列进行单核苷酸多态性分析.结果表明:与牛基因序列(AF252504S2)相比,牦牛基因在10 581bp处发生了G→A转换,位于第12内含子,表现出3种基因型,其中A、B基因频率分别为0.698 9和0.301 1,AA、AB和BB基因型频率分别为0.475 1、0.447 5和0.077 3,遗传杂合度(He)和多态信息含量(PIC)分别为0.420 9和0.332 3;在5 837bp处发生G→T的转换,位于第9内含子,表现出3种基因型,A、B基因频率分别为0.908 8和0.091 2,AA、AB和BB基因型频率分别为0.828 7、0.160 2和0.011 1,遗传杂合度(He)多态信息含量(PIC)分别为0.165 7和0.152 0;牦牛在这2个位点上处于Hardy-Weinberg平衡状态.

主 题 词:牦牛 钙激活蛋白酶基因 PCR-SSCP SNPs 

学科分类:0905[农学-林学类] 09[农学] 

D O I:10.3969/j.issn.1003-4315.2010.04.006

馆 藏 号:203102801...

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