猪链球菌Lmb、Sao、ZnuA蛋白的抗原表位、二级结构分析及重组表位疫苗分子的设计

作     者：刘祥 Xiang Liu

作者机构：陕西理工学院中德天然产物研究与开发利用联合研究所陕西汉中723001 

基　　金：国家 陕西省 陕西理工学院大学生创新创业训练计划项目("奶牛乳房炎三联重组多肽表位疫苗的研制及其抗原性分析" No.201510720556 No.1949 No.UIRP15006) 

出 版 物：《生物技术》 (Biotechnology)

年 卷 期：2016年第26卷第2期

页      码：181-187,204页

摘      要：[目的]利用生物信息学方法设计猪链球菌候选疫苗蛋白Lmb、Sao、Znu A的重组表位多肽分子。[方法]通过ABCpred和Bepi Pred方案,预测猪链球菌Lmb、Sao、Znu A蛋白的B细胞表位。运用神经网络与量化矩阵法预测蛋白的CTL表位。使用MHC-Ⅱ类分子结合肽预测蛋白的Th表位。采用DNASTAR软件与SOPMA服务器预测蛋白二级结构,进而验证获得的B/T细胞表位的准确性。通过DNASTAR Protean软件重组拼接获得的B/T细胞抗原表位,设计抗原性较好的猪链球菌重组表位多肽。[结果]猪链球菌Lmb、Sao、Znu A蛋白的优势B细胞表位数分别为4个、4个和3个;CTL表位数各为1个;Th表位数分别为2个、1个和1个。二级结构预测显示这些表位大多处于蛋白易于产生表位的暴露表面、无规则卷曲与转角等位置。并设计获得抗原性较好的重组表位多肽。[结论]设计了抗原性较好的猪链球菌Lmb、Sao、Znu A蛋白的重组表位多肽。

主 题 词：猪链球菌 细胞表位 蛋白结构 重组表位多肽 

学科分类：090603[090603] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

D　O　I：10.16519/j.cnki.1004-311x.2016.02.0033

馆 藏 号：203102855...