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火龙果Ty1-copia类反转录转座子反转录酶序列的克隆及分析

火龙果Ty1-copia类反转录转座子反转录酶序列的克隆及分析

作     者:范付华 乔光 郑思成 文晓鹏 

作者机构:贵州大学贵州省农业生物工程重点实验室贵阳550025 

基  金:国家自然科学基金项目(31060256) 

出 版 物:《园艺学报》 (Acta Horticulturae Sinica)

年 卷 期:2012年第39卷第2期

页      码:265-272页

摘      要:根据Ty1-copia类反转录转座子反转录酶的保守区设计简并引物,通过PCR扩增,从火龙果基因组中扩增出260bp左右的目标条带,经回收、克隆、测序及序列分析,获得了23条来源于火龙果试管苗变异和非变异材料的反转录酶序列。通过系统演化分析,所得序列可分为5类,存在较高的异质性;与母株相比,变异植株的反转录酶序列存在缺失、移码和终止密码子突变。经反转录酶氨基酸序列对比,火龙果与其它物种间具有较高的同源性,表明在不同物种间可能存在反转录转座子的横向传递作用。

主 题 词:火龙果 变异 Ty1-copia类反转录转座子 反转录酶 异质性 

学科分类:09[农学] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090201[090201] 

核心收录:

D O I:10.16420/j.issn.0513-353x.2012.02.013

馆 藏 号:203103493...

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