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多亲本杂交衍生的多个相关群体QTL作图的通用方法

多亲本杂交衍生的多个相关群体QTL作图的通用方法

作     者:敖雁 胡治球 汤在祥 王学枫 徐辰武 

作者机构:扬州大学江苏省作物遗传生理重点实验室江苏扬州225009 

基  金:国家自然科学基金资助项目(30270724 30370758) 扬州大学科技创新培育基因资助项目(2006CXJ010) 

出 版 物:《中国水稻科学》 (Chinese Journal of Rice Science)

年 卷 期:2008年第22卷第4期

页      码:427-431页

摘      要:对多亲本杂交衍生的多个群体的联合分析将有助于QTL的定位和基于QTL分析的育种实践,但目前还没有一个可对这类群体进行联合分析的通用方法。在以往发展的双亲杂交衍生的多个相关群体QTL图谱的联合构建方法的基础上,进一步拓展为可以对多个亲本杂交衍生的多个相关群体进行联合分析。首先建立了多亲本杂交衍生的多个相关群体QTL联合作图的通用遗传模型,然后根据混合分布理论建立基于EM(expectationmaximization)算法实现的QTL作图的极大似然估计方法。以循环杂交设计的3个F2群体为例用计算机模拟数据研究了QTL遗传力和样本容量2个因素对方法的影响。结果表明,无论是统计功效,还是参数估计的准确度和精确度,相同遗传力下,对循环杂交设计的3个F2群体联合作图均优于对其中的任2个F2群体联合作图。该方法的主要优点:一是可以比较和综合已有的对单个作图群体的定位结果,提高QTL检测的功效和定位的精度;二是在多亲本涉及的等位基因数更多的情形下,可以扩大和发掘有关数量性状的基因资源,从而为育种学家改良相应的数量性状奠定重要基础。

主 题 词:相关群体 数量性状座位 基因定位 极大似然估计方法 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

核心收录:

D O I:10.16819/j.1001-7216.2008.04.016

馆 藏 号:203103506...

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