基于疏水性小波分析的膜蛋白结构预测

作     者：邱建丁 荣联清 梁汝萍 李荫 邹小勇 莫金垣 

作者机构：中山大学化学与化学工程学院广州510275 萍乡高等专科学校化工系萍乡337055 萍乡高等专科学校化工系萍乡337055 中山大学化学与化学工程学院广州510275 

基　　金：国家自然科学基金(29975033)和广东省自然科学基金(001237) 

出 版 物：《分析试验室》 (Chinese Journal of Analysis Laboratory)

年 卷 期：2003年第22卷第Z1期

页      码：306-309页

摘      要：膜蛋白在细胞膜上具有重要的生理功能,大部分膜蛋白在药物设计、转运蛋白和免疫识别等方面起着关键的作用,从分子水平上预测这类蛋白质的结构具有非常重要的意义.本文提出一种基于氨基酸疏水性小波变换技术预测膜蛋白跨膜区段数目和位置的新方法.以代码为upkb-bovin的膜蛋白为例,对跨膜螺旋区数目和位置的预测分析进行了描述.从膜蛋白数据库中随机抽取36个蛋白质(含跨膜螺旋区232)作为测试集检验小波分析的预测方法,其中226个跨膜螺旋区能被准确预测,准确率为96.8%.结果表明,这种预测方法具有较高的预测准确性.

主 题 词：小波变换 跨膜螺旋区 疏水性 预测 

学科分类：081704[081704] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-轻工类] 070302[070302] 0703[理学-化学类] 

核心收录：

D　O　I：10.3969/j.issn.1000-0720.2003.z1.148

馆 藏 号：203103851...