油桐β-酮脂酰-ACP还原酶(KAR)基因的克隆与序列分析

作     者：刘美兰 谭晓风 龙洪旭 张琳 周俊琴 王建勇 LIU Mei-Lan;TAN Xiao-Feng;LONG Hong-Xu;ZHANG Lin;ZHOU Jun-Qin;WANG Jian-Yong

作者机构：中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室湖南长沙410004 

基　　金：国家林业公益性行业科研专题(200904023) 国家林业公益性行业科研专项重点项目(201204403) 

出 版 物：《江西农业大学学报》 (Acta Agriculturae Universitatis Jiangxiensis)

年 卷 期：2013年第35卷第5期

页      码：962-969页

摘      要：以葡萄桐近成熟种子为材料,根据油桐转录组测序分析结果设计引物,利用RT-PCR技术克隆获得了2条KAR基因的全长cDNA,分别命名为Vf_KAR1和Vf_KAR2(GenBank登录号:KF025646,KF025647)。生物信息学分析结果表明,Vf_KAR1和Vf_KAR2基因的CDS长度分别为993 bp和900 bp,分别编码331个和300个氨基酸;与其它物种的KAR氨基酸序列具有较高的相似性,Vf_KAR1与蓖麻的相似度最高,达82%;Vf_KAR2基因与花生、辣椒的相似度高达76%;2条KAR基因的多肽都含叶绿体转运肽,但是都没有信号肽;Vf_KAR1有1个明显的跨膜螺旋拓扑结构和1个疑似跨膜螺旋拓扑结构,Vf_KAR2有2个疑似的跨膜螺旋拓扑结构;肽链都表现为疏水性,都有典型的活化中心三联体(Ser-Tyr-Lys);三级结构都有典型的Rossmann折叠特征。因此,初步推测Vf_KAR1和Vf_KAR2是油桐β-酮脂酰-ACP还原酶KAR基因家族的两个成员。

主 题 词：油桐 β-酮脂酰-ACP还原酶 Vf_KAR1 Vf_KAR2 生物信息学 

学科分类：0907[农学-草药学] 08[工学] 0829[工学-安全科学与工程类] 09[农学] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1000-2286.2013.05.012

馆 藏 号：203104275...