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酶工程:从人工设计到人工智能

酶工程:从人工设计到人工智能

作     者:王雅丽 付友思 陈俊宏 黄佳城 廖浪星 张永辉 方柏山 WANG Yali;FU Yousi;CHEN Junhong;HUANG Jiacheng;LIAO Langxing;ZHANG Yonghui;FANG Baishan

作者机构:厦门大学化学化工学院福建厦门361005 厦门市合成生物学重点实验室福建厦门361005 福建省化学生物学重点实验室福建厦门361005 集美大学食品与生物工程学院福建厦门361021 

基  金:国家自然科学基金项目(21978245) 

出 版 物:《化工学报》 (CIESC Journal)

年 卷 期:2021年第72卷第7期

页      码:3590-3600页

摘      要:计算机在酶工程中的应用使得酶的序列空间探索度不断被扩大。随着不同分子力场参数的建立,涌现出诸多以计算分子能量为基础的算法,并被用于酶的催化活性、稳定性、底物特异性等的改造与筛选。伴随计算机硬件的提升与算法的优化,从头设计全新功能的人工酶取得成功并得以发展。近年来,人工智能在蛋白质结构预测上不断获得突破,同时也被应用到酶的设计中。介绍了分子力场基础和酶设计与筛选的算法,重点阐述了从头设计的方法和成功案例,以及机器学习设计酶的流程和最新的研究进展,展望了人工智能在酶工程领域的未来发展,为酶的改造与全新功能的生物催化剂的设计助力。

主 题 词:酶工程 从头设计 人工智能 机理 能量函数 

学科分类:08[工学] 082203[082203] 0822[工学-核工程类] 

核心收录:

D O I:10.11949/0438-1157.20201941

馆 藏 号:203104364...

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