嗜热链球菌CRISPR-Cas系统的检测

作     者：李婉 梁宏彰 张丹青 王娜娜 唐雅茹 李柏良 霍贵成 Wan Li;Hongzhang Liang;Danqing Zhang;Nana Wang;Yaru Tang;Bailiang Li;Guicheng Huo

作者机构：东北农业大学乳品科学教育部重点实验室黑龙江哈尔滨150030 

基　　金：国家自然科学基金(31171717) 国家"863计划"(2012AA022108) 

出 版 物：《微生物学报》 (Acta Microbiologica Sinica)

年 卷 期：2016年第56卷第4期

页      码：680-688页

摘      要：【目的】CRISPR-Cas系统为嗜热链球菌抵抗噬菌体等外源基因元件提供获得性免疫,分析NCBI中已公开发表全基因组序列的9株嗜热链球菌所含CRISPR-Cas系统的数目和类型,对实验室相应菌株的CRISPR-Cas系统进行检测。【方法】利用生物信息学方法对NCBI中9株已测序嗜热链球菌所含CRISPR-Cas系统进行分析,根据其Cas基因序列设计引物,对实验室嗜热链球菌菌株的Cas基因进行扩增、测序,分析实验室6株嗜热链球菌的CRISPR-Cas系统情况。【结果】9株标准菌株均含不同数目的CRISPR-Cas系统,其类型主要为Ⅱ-A型、Ⅲ-A型和Ⅰ-E型,各类型的标志Cas基因高度保守。6株供试菌中,S4仅含Cas9基因,其它5株均含有Cas9基因、Cas10基因和Cas9*基因,79和KLDS3.0207还含有Cas3基因。【结论】可根据标准菌株高度保守的Cas基因设计引物,预测未知嗜热链球菌所含CRISPRCas系统的数目和类型。S4仅含1个Ⅱ-A型CRISPR-Cas系统,其它5株均含有2个Ⅱ-A型CRISPR-Cas系统和1个Ⅲ-A型CRISPR-Cas系统,此外,79和KLDS3.0207均含有1个Ⅰ-E型CRISPR-Cas系统。

主 题 词：嗜热链球菌 规律成簇的间隔回文重复(CRISPR) CRISPR-Cas系统 Cas 生物信息学分析 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

核心收录：

D　O　I：10.13343/j.cnki.wsxb.20150314

馆 藏 号：203104386...