基于AOX1和MCM5基因水芹地方品种的遗传关系分析及‘玉祁红芹’ISSR-SCAR标记建立

作     者：王月 刘佳 陈闽 张艳梅 孙小芹 杭悦宇 周广灿 WANG Yue;LIU Jia;CHEN Min;ZHANG Yanmei;SUN Xiaoqin;HANG Yueyu;ZHOU Guangcan

作者机构：江苏省中国科学院植物研究所(南京中山植物园)江苏南京210014 菏泽学院农业与生物工程学院山东菏泽274015 

基　　金：江苏省自然科学基金青年基金项目(BK20200292 BK20180316) 

出 版 物：《植物资源与环境学报》 (Journal of Plant Resources and Environment)

年 卷 期：2021年第30卷第4期

页      码：50-59页

摘      要：基于低拷贝核基因AOX1和MCM5的扩增结果,对采自南京的水芹〔Oenanthe javanica(Bl.)DC.〕野生种和太湖流域6个地方品种进行了遗传多样性分析,并基于ISSR标记开发了两步法鉴定‘玉祁红芹’(‘Yuqihongqin’)的SCAR标记。结果显示:水芹6个地方品种的AOX1基因中检测到22个SNP位点和7个InDel位点;MCM5基因中检测到33个SNP位点,其中3个位于编码区且均为同义突变,还有1个位于非编码区的InDel位点。与MCM5基因相比,AOX1基因提供的信息位点更多,基于AOX1基因构建的水芹野生种和6个地方品种的ML遗传关系树的支持率相对较高;其中‘玉祁红芹’、‘苏州圆叶芹’(‘Suzhouyuanyeqin’)和‘梅南水芹’(‘Meinanshuiqin’)的遗传关系较近,而‘常熟白芹’(‘Changshubaiqin’)、‘溧阳白芹’(‘Liyangbaiqin’)和‘江阴青芹’(‘Jiangyinqingqin’)的遗传关系较近。基于ISSR-880引物扩增得到‘溧阳白芹’的特异性片段,设计的第1对SCAR引物鉴定出‘玉祁红芹’和‘溧阳白芹’2个地方品种,再利用ISSR-836引物扩增得到‘玉祁红芹’特异性片段,设计的第2对SCAR引物在‘玉祁红芹’所有单株中扩增出特异性条带,而在‘溧阳白芹’所有单株中均未出现此条带。本研究开发的两步法鉴别‘玉祁红芹’的ISSR-SCAR标记可为水芹其他地方品种的鉴定、保存和利用提供参考。

主 题 词：水芹 ‘玉祁红芹’ AOX1基因 MCM5基因 遗传关系 ISSR-SCAR标记 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 071001[071001] 07[理学] 09[农学] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090202[090202] 

核心收录：

D　O　I：10.3969/j.issn.1674-7895.2021.04.06

馆 藏 号：203104724...