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基于重组酶介导等温扩增技术的3种棘球绦虫核酸检测方法的建立及初步应用

基于重组酶介导等温扩增技术的3种棘球绦虫核酸检测方法的建立及初步应用

作     者:张学勇 简莹娜 郭志宏 朵红 魏彦明 ZHANG Xue-Yong;JIAN Ying-Na;GUO Zhi-Hong;DUO Hong;WEI Yan-Ming

作者机构:甘肃农业大学动物医学院兰州730070 青海大学畜牧兽医科学院 

基  金:国家自然科学基金地区基金(31860700) 家畜疫病病原生物学国家重点实验室开放基金课题(SKLVEB2020KFKT004) 

出 版 物:《中国血吸虫病防治杂志》 (Chinese Journal of Schistosomiasis Control)

年 卷 期:2021年第33卷第4期

页      码:339-345页

摘      要:目的基于重组酶介导的等温扩增技术(recombinase-aided isothermal amplification assay,RAA)建立一种快速检测多房棘球绦虫、细粒棘球绦虫和石渠棘球绦虫的多重核酸检测方法,并对其检测效果进行初步评价。方法分别以多房棘球绦虫(GenBank登录号:NC 000928)、细粒棘球绦虫(GenBank登录号:NC044548)和石渠棘球绦虫(GenBank登录号:NC009460)线粒体基因组序列为靶序列,依据RAA引物设计基本原则设计、合成3对引物,并进行多重RAA扩增。分别扩增不同浓度3种棘球绦虫基因组DN A和不同浓度含3种靶基因的重组质粒,以评价多重RAA检测方法的敏感性;同时采用该方法检测3种棘球绦虫及多头带绦虫、牛带绦虫、亚洲带绦虫、犬复孔绦虫、泡状带绦虫、犬弓首蛔虫、肝片形吸虫、豆状带绦虫、中线绦虫和犬隐孢子虫基因组DNA,以评价该方法的特异性。优化建立的多重RAA法的条件,再检测棘球蚴病病变组织样本、模拟犬粪便样本和现场狐狸粪便样本,以评价该方法的应用价值。结果所建立的多重RAA检测方法可在39℃时40 min内特异性扩增多房棘球绦虫、细粒棘球绦虫和石渠棘球绦虫线粒体基因片段,长度分别约为540、430 bp和200 bp。该多重RAA法对多房棘球绦虫、细粒棘球绦虫和石渠棘球绦虫基因组DNA的最低检测限为2.0、2.5 pg/μL和3.1 pg/μL,对含多房棘球绦虫、细粒棘球绦虫和石渠棘球绦虫靶基因的重组质粒的最低检测限均可达到200拷贝/μL;该多重RAA法可以同时检测出多房棘球绦虫、细粒棘球绦虫和石渠棘球绦虫单一感染和多重感染,对多头带绦虫、牛带绦虫、亚洲带绦虫、犬复孔绦虫、泡状带绦虫、犬弓首蛔虫、肝片形吸虫、豆状带绦虫、中线绦虫和犬隐孢子虫无扩增。优化后的多重RAA法能够检测出全部棘球蚴病病变组织样本及模拟犬粪样本和现场狐狸粪便样本中的阳性样品,且与单一PCR法检测结果完全一致。结论成功建立了一种可用于多房棘球绦虫、细粒棘球绦虫和石渠棘球绦虫基因组DN A快速检测的多重RAA法,特异性和敏感性均较高。

主 题 词:多房棘球绦虫 细粒棘球绦虫 石渠棘球绦虫 重组酶介导的等温扩增技术 多重核酸检测 

学科分类:1001[医学-基础医学] 100103[100103] 10[医学] 

核心收录:

D O I:10.16250/j.32.1374.2021094

馆 藏 号:203104863...

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