间隔臂和探针长度与寡核苷酸芯片重复性相关性研究

作     者：潘继红 韩金祥 

作者机构：山东省医药生物技术研究中心国家卫生部生物技术药物重点实验室南250062 

基　　金：国家攻关项目 山东省重点攻关项目 山东省优秀中青年奖励基金项目 

出 版 物：《生物技术通讯》 (Letters in Biotechnology)

年 卷 期：2003年第14卷第1期

页      码：12-15页

摘      要：研究寡核苷酸芯片的重复性与间隔臂(spacer)和探针长度之间的相关性。设计12条不同长度的带有不同spacer的探针,与749bp荧光标记靶序列杂交。扫描分析三次杂交结果,用Quantarray定量分析软件进行分析。随探针长度的延长,杂交信号的变异系数逐步降低。15mer的探针杂交的信号较弱,杂交不够稳定,重复性也相对较差。20mer、25mer、30mer的探针的变异系数逐渐降低。spacer为15时变异系数最小。说明选择spacer为poly(dT)15的25mer和30mer的探针可以获得较好的重复性。

主 题 词：间隔臂 探针长度 寡核苷酸芯片 相关性 杂交重复性 变异系数 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 071010[071010] 081704[081704] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-轻工类] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1009-0002.2003.01.004

馆 藏 号：203104951...