栽培种花生Ty1-copia类反转录转座子反转录酶序列的克隆及分析

作     者：熊发前 刘菁 阳太亿 蒋菁 贺梁琼 唐秀梅 韩柱强 钟瑞春 吴海宁 黄志鹏 唐荣华 刘俊仙 XIONG Fa-qian;LIU Jing;YANG Tai-yi;JIANG Jing;HE Liang-qiong;TANG Xiu-mei;HAN Zhu-qiang;ZHONG Rui-chun;WU Hai-ning;HUANG Zhi-peng;TANG Rong-hua;LIU Jun-xian

作者机构：广西农业科学院经济作物研究所广西南宁530007 广西农业科学院甘蔗研究所广西南宁530007 

基　　金：国家自然科学基金项目(31960409,31960416) 广西自然科学基金项目(2018GXNSFDA281027,2018GXNSFDA294004,2020GXNSFAA297081) 广西农业科学院科技发展基金项目(桂农科2018YM06,桂农科2017JZ13,桂农科31960409,桂农科2021YT052) 

出 版 物：《花生学报》 (Journal of Peanut Science)

年 卷 期：2021年第50卷第3期

页      码：1-10页

摘      要：克隆Ty1-copia类反转录转座子反转录酶序列并分析其特性,为开发栽培种花生基于LTR反转录转座子的分子标记奠定基础。根据Ty1-copia类反转录转座子反转录酶的保守区设计简并引物对,利用PCR技术对栽培种花生品种“桂花1026”的基因组DNA进行扩增,目的条带经回收、克隆、测序,最后对序列进行生物信息学分析。目的条带大小约260 bp,克隆获得了34条反转录酶序列,序列长度变化范围为256~267 bp,AT所占比例范围为51.36%~67.79%,AT与GC比例范围为1.06~2.10,序列间相似性范围为44.9%~98.5%,序列存在较高异质性,表现为缺失突变与点突变;34条反转录酶序列系统聚类为3个家族,家族Ⅰ和家族Ⅱ分别占到了总序列数的55.88%和35.29%;翻译成氨基酸后,有14条序列发生了无义突变,序列间相似性范围为11.4%~98.9%,呈现高度异质性;序列间保守基序也存在较大差异,呈现较高异质性;对栽培种花生与其他物种植物该类型反转录酶的氨基酸序列构建系统进化树,结果显示所有序列被分为7类,其中Ⅰ类和Ⅱ类分别包含16条和11条栽培种花生反转录酶序列,表明栽培种花生反转录酶序列具有比较高的保守性,同时栽培种花生也与葡萄、马铃薯、辣椒、烟草、番茄、大豆、甜菜、草莓等物种植物的反转录酶序列之间具有较近的亲缘关系,表明不同物种植物的Ty1-copia类反转录转座子之间有可能存在着横向传递。本研究所获得的反转录酶序列为栽培种花生Ty1-copia反转录转座子的分子标记开发利用及花生分子育种奠定了一定基础。

主 题 词：栽培种花生 Ty1-copia类反转录转座子 反转录酶 异质性 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

D　O　I：10.14001/j.issn.1002-4093.2021.03.001

馆 藏 号：203104996...