药用模式真菌灵芝小G蛋白基因家族的系统性分析

作     者：任昂 曹鹏飞 吴凤礼 李梦娇 姜爱良 师亮 赵明文 REN Ang;CAO Pengfei;WU Fengli;LI Mengjiao;JIANG Ailiang;SHI Liang;ZHAO Mingwen

作者机构：南京农业大学生命科学学院/农业部农业环境微生物重点实验室江苏南京210095 

基　　金：国家科技支撑计划项目(2013BAD20B05-04) 江苏省科技支撑计划项目(BE2014338) 江苏省博士后科研资助项目(1402020B) 中国博士后科学基金项目(2015M570456) 

出 版 物：《南京农业大学学报》 (Journal of Nanjing Agricultural University)

年 卷 期：2015年第38卷第6期

页      码：923-929页

摘      要：[目的]利用比较基因组学方法,对药用模式真菌灵芝的基因组中的小G蛋白基因家族成员进行系统的预测分析和比较。[方法]利用真菌物种中已经报道的小G蛋白,对灵芝全基因组进行BLAST分析,筛选出所有灵芝的小G蛋白基因,并分析这些同源小G蛋白的基本特性。通过小G蛋白家族的进化树分析和功能域分析,解析灵芝小G蛋白家族成员的进化关系。设计每一个小G蛋白同源基因的特异性引物,通过实时荧光定量PCR检测小G蛋白同源基因的表达。[结果]在灵芝中发现了29个小G蛋白家族基因,其中Ras亚家族4个,Rho亚家族4个,Rab亚家族12个,Arf亚家族7个,Ran亚家族1个,还有1个线粒体小G蛋白。菌丝体中有28个小G蛋白基因表达。[结论]根据真菌中已知的小G蛋白系统性地分析了灵芝的小G蛋白家族成员,进行灵芝小G蛋白的特性分析和基因实时荧光定量PCR检测,为下一步研究灵芝小G蛋白家族成员的功能奠定基础。

主 题 词：灵芝 小G蛋白 功能域分析 实时荧光定量PCR 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 1007[医学-药学类] 100705[100705] 07[理学] 071005[071005] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.7685/j.issn.1000-2030.2015.06.008

馆 藏 号：203105235...