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教研中Excel对抗菌肽分子设计的辅助研究

教研中Excel对抗菌肽分子设计的辅助研究

作     者:李伟忠 薛佳桢 高峰涛 于海瑞 LI Wei-zhong;XUE Jia-zhen;Gao Fengtao;YU Hai-rui

作者机构:潍坊学院现代设施渔业研究院山东潍坊261061 潍坊学院生物与农业工程学院山东潍坊261061 

基  金:山东省重点研发计划项目(2018CXGC0102) 潍坊市科学技术发展计划(2019GX008) 潍坊学院博士基金(2020BS21) 

出 版 物:《潍坊学院学报》 (Journal of Weifang University)

年 卷 期:2020年第20卷第6期

页      码:15-19页

摘      要:减少盲目设计、缩短试验周期及降低材料费用是抗菌肽(AMPs)分子设计不懈追求的目标,关键理化参数的预测是AMPs设计的重要手段,如何依据复杂的数学模型快速计量理化参数成为教研中亟待解决的问题。因此,本研究基于AMPs的理化参数计算原理,以3种氨基酸疏水值为模型,运用MS-Excel软件设计出平均疏水性和疏水力矩两参数计算平台。与手工或线上计算相比,此平台具有离线、自动、无延迟、可任选疏水值模型的特点,录入肽序列即可完成参数的运算。通过对Excel内置功能集成设计,极大提高了AMPs分子设计的效率,对推动科研工作高效开展具有重要意义。

主 题 词:抗菌肽 辅助设计 疏水力矩 疏水性 Excel 

学科分类:1007[医学-药学类] 100705[100705] 10[医学] 

D O I:10.3969/j.issn.1671-4288.2020.06.004

馆 藏 号:203105347...

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