四川部分地区猪流行性腹泻的分子流行病学调查

作     者：阳酉萍 黄小波 曹三杰 文心田 梁恩涛 张丹 张小会 段素芬 朱书全 文翼平 伍锐 

作者机构：四川农业大学动物医学学院动物传染病与基因芯片实验室四川雅安625014 四川农业大学人兽共患病研究室与猪病防治研究中心四川成都611130 

基　　金：国家自然科学基金资助项目(31072144) 国家公益性行业(农业)科研专项基金资助项目(20123056) 

出 版 物：《中国兽医学报》 (Chinese Journal of Veterinary Science)

年 卷 期：2015年第35卷第5期

页      码：704-710页

摘      要：本研究对四川猪流行性腹泻病毒(PEDV)开展了分子流行病学调查。参照毒株CV777的M基因序列,设计1对特异性引物(预期扩增大小为392bp),建立了快速检测PEDV的RT-PCR技术,对四川9个地区规模化猪场的75份仔猪腹泻病料进行检测与分析。再根据S基因的变异区域设计1对引物(扩增大小为947bp),选择扩增了四川9个地区的代表样品的S基因序列,并进行了进化与变异分析。结果显示,建立了检测PEDV的M基因的RT-PCR技术,并确定了最佳反应条件和反应体系,用该方法检测了四川75份腹泻病料,检出64份PEDV阳性,PEDV阳性检出率为86.67%,结果显示PEDV在四川地区发病季节除冬春季外,近年夏季也呈高发趋势。四川9株PEDV的S基因的核苷酸同源性为95.9%~100%,氨基酸同源性为95.1%~100%,四川毒株与14个国内外参考毒株的核苷酸同源性和氨基酸同源性分别为84.6%~99.5%和84.2%~99.5%;四川流行毒株的S基因(S蛋白)存在碱基(氨基酸)缺失和插入现象。结果表明,本研究从分子流行病学角度证实了四川部分地区PEDV的流行与变异情况,为指导该地区PEDV科学防控提供了依据。

主 题 词：猪流行性腹泻 M基因 RT-PCR M基因 分子流行病学 序列分析 

学科分类：090603[090603] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

D　O　I：10.16303/j.cnki.1005-4545.2015.05.013

馆 藏 号：203105433...