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16S rRNA基因联合gyrB、grpE、recA基因对鸡源鲍氏志贺菌hn03株进行分子起源分析

16S rRNA基因联合gyrB、grpE、recA基因对鸡源鲍氏志贺菌hn03株进行分子起源分析

作     者:杨霞 陈陆 赵军 王新卫 常洪涛 刘红英 姚慧霞 王川庆 

作者机构:河南农业大学牧医工程学院河南郑州450002 

基  金:国家自然科学基金资助项目(30671555) 

出 版 物:《中国兽医学报》 (Chinese Journal of Veterinary Science)

年 卷 期:2011年第31卷第7期

页      码:983-989页

摘      要:为了从基因水平鉴定鸡源鲍氏志贺菌,分别根据GenBank中登陆的相应序列针对16S rRNA、gyrB、grpE、re-cA 4基因设计4对引物,用PCR扩增出鸡源鲍氏志贺菌4基因的部分片段并进行了克隆测序。将所获序列与Gen-Bank中同源性较高的相关序列相比较,计算种间相似性,并构建志贺菌的系统发育树,对分离株进行分类与鉴定。研究发现,从4基因的序列分析结果总体上可知鸡源志贺菌与人鲍氏志贺菌同源关系最近,同源性达99.6%~100%。几乎所有志贺菌均落入大肠杆菌的分支中,且在鉴别细菌中recA基因和gyrB基因比传统中常用的16SrRNA基因差异更显著。由此证明用细菌分类和鉴定的"金标准"16SrRNA联合gyrB、grpE、recA3个基因进行序列分析来鉴定志贺菌是一种可靠、成本较低的方法;由上述基因序列构建的系统发育树提示,该株鸡源志贺菌可能是与人志贺菌密切相关的新种或是它们的亚种。

主 题 词:鸡鲍氏志贺菌 16S rRNA gyrB grpE recA 同源性分析 

学科分类:090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

核心收录:

D O I:10.16303/j.cnki.1005-4545.2011.07.005

馆 藏 号:203105693...

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