宽叶缬草SRAP-PCR反应体系的优化及引物筛选

作     者：梁芳瑜 何茂秋 徐昌艳 杨小生 杨娟 罗忠圣 覃容贵 LIANG Fang-yu;HE Mao-qiu;XU Chang-yan;YANG Xiao-sheng;YANG Juan;LUO Zhong-sheng;QIN Rong-gui

作者机构：贵州医科大学药学院贵阳550025 贵州省中国科学院天然产物化学重点实验室贵阳550014 省部共建药用植物功效与利用国家重点实验室贵阳550014 

基　　金：贵州省教育厅青年科技人才成长项目(黔教科合KY字183) 贵州省教育厅高等学校特色重点实验室平台项目(黔教合KY字018号) 2019年大学生创新创业训练计划项目(20195200144) 贵州省发改委工程中心项目(黔财建303号) 

出 版 物：《中国实验方剂学杂志》 (Chinese Journal of Experimental Traditional Medical Formulae)

年 卷 期：2021年第27卷第23期

页      码：163-171页

摘      要：目的:建立宽叶缬草的相关序列扩增多态性(SRAP)-聚合酶链式反应(PCR)反应体系,为宽叶缬草良种选育提供理论和技术基础。方法:采用单因素试验考察Taq Mix用量,Mg^(2+)浓度,模板DNA浓度,Taq DNA聚合酶浓度对宽叶缬草SRAP-PCR扩增结果的影响,以此为基础进行正交试验,优化宽叶缬草SRAP-PCR反应体系,并在最优反应体系条件下筛选可用于宽叶缬草遗传多样性研究的有效引物。结果:单因素实验结果表明Taq Mix用量为8~11μL时扩增效果较佳;加入低浓度Mg^(2+)可获得较佳扩增效果;中低浓度模板DNA用量可提高扩增效果;加入少量Taq DNA聚合酶可增加扩增结果丰富度。正交实验结果表明各因素对宽叶缬草SRAP-PCR扩增结果的影响程度大小依次为Taq Mix用量>Taq DNA聚合酶加入量>Mg^(2+)加入量>模板DNA用量。适于宽叶缬草的最优反应体系为Taq Mix 11μL,模板DNA 30 ng,Mg^(2+)0.025 mmol·L^(-1),Taq DNA1.5 U,正向引物与反向引物各5μmol·L^(-1),用双蒸水补足体系至20μL。最优退火温度为36.8℃。应用最优体系从88对引物中筛选出17对适用于宽叶缬草SRAP-PCR的条带清晰、多态性较高的有效引物。结论:建立的宽叶缬草SRAP-PCR反应体系稳定性良好,可用于宽叶缬草遗传多样性研究。

主 题 词：宽叶缬草 相关序列扩增多态性(SRAP) 体系优化 引物筛选 正交试验设计 

学科分类：1008[医学-中药学类] 100504[100504] 1006[医学-中西医结合类] 1005[医学-中医学类] 100602[100602] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.13422/j.cnki.syfjx.20211412

馆 藏 号：203105780...