太岁DNA提取方法差异及对测知细菌结构的影响

作     者：王朝江 王世清 高春燕 李慧 李聪 WANG Chaojiang;WANG Shiqing;GAO Chunyan;LI Hui;LI Cong

作者机构：河北省农林科学院经济作物研究所石家庄050051 

基　　金：河北省农业关键共性技术攻关专项(162273030) 河北省农林科学院农业科技创新工程项目(2019-2-05-03) 

出 版 物：《扬州大学学报（农业与生命科学版）》 (Journal of Yangzhou University：Agricultural and Life Science Edition)

年 卷 期：2021年第42卷第5期

页      码：123-129页

摘      要：以太岁取样的加水热溶解为特点设计4种提取方法,将提取效果好的2个DNA样品用Illumina MiSeq高通量测序平台测序。结果表明:滤膜法(SI3)和研磨法均可获得显示电泳条带的DNA,但前者能将太岁材料彻底破碎和滤除多糖;滤膜法样品测得优质序列46676条,聚类OTU 1095个,比研磨法多154个,只包含1个序列相对丰度大于1%的共有OTU,特有1个序列相对丰度41.14%的OTU,是研磨法的237倍,但滤膜法样品香农指数反比研磨法低1.37%,并导致两者菌群结构在各分类水平上有着明显差别。太岁DNA提取方法深刻影响细菌结构测定结果,滤膜法DNA菌群信息更真实,据其测知的优势结构为假单胞菌属(Pseudomonas)和不动杆菌属(Acinetobacter)。

主 题 词：太岁 DNA提取方法 细菌结构 高通量测序 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 071001[071001] 07[理学] 

D　O　I：10.16872/j.cnki.1671-4652.2021.05.021

馆 藏 号：203106063...