芒属植物叶绿体InDel标记的开发与应用

作     者：薛宏 易自力 肖亮 丁力 彭思佳 蒋建雄 XUE Hong;YI Zi-li;XIAO Liang;DING Li;PENG Si-jia;JIANG Jian-xiong

作者机构：湖南农业大学生物科学技术学院湖南长沙410128 湖南省蚕桑科学研究所 

基　　金：863计划(2012AA10180104) 国家支撑计划(2013BAD22B01) 

出 版 物：《现代农业科技》 (Modern Agricultural Science and Technology)

年 卷 期：2015年第7期

页      码：153-155,159页

摘      要：研究利用芒属植物(芒02381和荻04005)叶绿体全基因组测序的结果,开发12对InDel标记。采用正交设计法优化cpInDelPCR体系,得到模板DNA、dNTPs、Mg2+、引物、TaqDNA聚合酶5个关键因素在体系中的最佳组合。12对InDel标记对43份芒属和2份甘蔗材料进行扩增,共扩增出538条条带,其中3对引物扩增出13条多态性条带,占总数的2.4%。将所有位点读带转化为数值矩阵并用UPGMA法聚类,在遗传相似系数1.4的水平上,和南荻聚为一类,而芒和与五节芒、双药芒、红山茅、尼泊尔芒、甘蔗聚为一类,4个具有杂交种特征的材料单独聚为一类。试验开发的芒属植物cpInDel标记可用于芒与荻的区分,指导芒属植物的杂交育种。

主 题 词：芒属植物 叶绿体 InDel标记 育种 应用 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 090102[090102] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1007-5739.2015.07.094

馆 藏 号：203106295...