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不同性别类型黄瓜ACC合酶基因的单核苷酸多态性标记和酶切扩增长度多态性标记

不同性别类型黄瓜ACC合酶基因的单核苷酸多态性标记和酶切扩增长度多态性标记

作     者:向太和 王利琳 庞基良 胡江琴 申屠连峰 吴锴 XIANG Tai-He;WANG Li-Lin;PANG Ji-Liang;HU Jiang-Qin;SHENTU Lian-Feng;WU Kai

作者机构:杭州师范学院生命科学学院杭州310036 

基  金:浙江省自然科学基金资助项目(Y304083) 

出 版 物:《生物化学与生物物理进展》 (Progress In Biochemistry and Biophysics)

年 卷 期:2006年第33卷第4期

页      码:362-367页

摘      要:黄瓜的性别分化与乙烯密切相关,1-氨基环丙烷-1-羧酸(ACC)合酶是乙烯生物合成过程中的关键酶.根据ACC合酶基因家族的保守序列设计PCR引物,从8个不同性别类型(雌雄同株、强雌性和全雌性)黄瓜品种中克隆了长度为1188bp的ACC合酶基因(CS-ACS2)片段(GenBank登记号为:DQ115884~DQ115886和DQ115875~DQ115879).经测序分析,3个雌雄同株性别类型品种的序列完全相同.与之相比,5个强雌性和全雌性品种中存在8个单核苷酸多态性(SNPs)标记,SNPs标记为4个A←→G和4个T←→C之间的转换.在8个SNPs中,有1个SNP位于内含子区域,其余7个SNPs都位于外显子区域.在7个位于外显子区域的SNPs中,有3个为非编码区的SNPs,4个为cSNPs.而在4个cSNPs中,有3个导致了编码的氨基酸序列改变.研究结果表明,与雌雄同株性别类型相比,雌性系中均存在单核苷酸的变异,这提示ACC合酶基因CS-ACS2的单核苷酸变异可能与黄瓜雌性系的发生形成有关.另一方面,根据SNP多态性还发展了一个酶切扩增长度多态性(CAPS)标记C-MT700.利用CAPS标记C-MT700能将强雌性优良品种MT-705与其他黄瓜品种相区别,该标记在黄瓜育种生产上具有一定的应用价值.此外,研究获得的SNPs标记和CAPS标记丰富了黄瓜的分子标记种类.

主 题 词:黄瓜 性别类型 1-氨基环丙烷-1-羧酸(ACC)合酶基因 单核苷酸多态性(SNP) 酶切扩增长度多态性(CAPS) 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 0831[工学-公安技术类] 07[理学] 09[农学] 071007[071007] 0703[理学-化学类] 0901[农学-植物生产类] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090102[090102] 090202[090202] 

核心收录:

D O I:10.3321/j.issn:1000-3282.2006.04.009

馆 藏 号:203106472...

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