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暗纹东方鲀线粒体COI及其侧翼tRNA基因的克隆与序列分析

暗纹东方鲀线粒体COI及其侧翼tRNA基因的克隆与序列分析

作     者:邵爱华 朱江 陈葵 史全良 姚炜雯 SHAO Ai-Hua;ZHU Jiang;CHEN Kui;SHI Quan-Liang;YAO Wei-Wen

作者机构:江苏省苏州大学生命科学学院 

基  金:农业部行业标准资助项目(编号:2002-04084) 苏州科技学院科研基金项目(编号:2005-Z862) 

出 版 物:《遗传》 (Hereditas(Beijing))

年 卷 期:2006年第28卷第8期

页      码:963-971页

摘      要:以暗纹东方鲀(Takifugu fasciatus)肝脏的线粒体DNA为模板,按照红鳍东方鲀线粒体DNA序列设计合成特异引物进行PCR扩增,克隆并测定了线粒体细胞色素氧化酶I亚基(COI)及其侧翼tRNA基因的全序列,结果显示,克隆了暗纹东方鲀COI基因1 546 bp及其5′端上游的tRNATyr基因和3′端下游的tRNASer基因序列共1 766 bp。用DNA分析软件对暗纹东方鲀与GenBank中10个目14种鱼类的COI序列进行比较分析,显示暗纹东方鲀与这些鱼类的COI基因具有较高的同源性,与同属红鳍东方鲀的同源性最高为97.6%,与同目不同科的矛尾翻车鲀和翻车鲀的同源性为76.5%和75.4%。根据暗纹东方鲀与其他1 314种鱼的COI基因序列同源性所建立的进化树,与传统的分类地位基本吻合。推定的这两种tRNA的二级结构都具有典型的三叶草型结构。

主 题 词:暗纹东方鲀 线粒体DNA COI 系统学 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 0905[农学-林学类] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 090501[090501] 0836[0836] 090102[090102] 

核心收录:

D O I:10.3321/j.issn:0253-9772.2006.08.011

馆 藏 号:203106542...

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