用SAM法分离谷子SSR位点的研究

作     者：贾小平 王天宇 黎裕 宋燕春 石云素 JIA Xiao-ping;WANG Tian-yu;LI Yu;SONG Yan-chun;SHI Yun-su

作者机构：河南科技大学农学院河南洛阳471003 中国农业科学院作物科学研究所北京100081 

基　　金：国家自然科学基金项目(2005CCA025002005DIA4J019) 

出 版 物：《河南农业科学》 (Journal of Henan Agricultural Sciences)

年 卷 期：2009年第38卷第8期

页      码：17-21页

摘      要：首次将SAM(选择扩增微卫星)法用于谷子SSR位点的分离,共获得163个含有SSR序列的克隆,其中unique SSR 106个,占所有SSR序列的65%,60个SSR序列的3′端成功设计特异引物,占unique SSR的56%。这60个SSR序列中,55个为完整型重复;5个为复合型重复,由2种不同的重复单元组成,没有发现不完整重复类型。同时讨论了SAM法在应用过程中应注意的一些关键技术环节,如接头连接、核苷酸选择策略、特异引物设计原则,及该方法存在的一些不足,如获得SSR重复次数少、一端侧翼序列缺失对扩增多态性的消极影响等。

主 题 词：谷子 选择扩增微卫星法 SSR 

学科分类：09[农学] 0901[农学-植物生产类] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1004-3268.2009.08.004

馆 藏 号：203107152...