结核分枝杆菌Rv0354c基因的克隆及生物信息学分析

作     者：李敏英 王楚彤 袁美丽 李柏青 许涛 汪洪涛 LI Minying;WANG Chutong;YUAN Meili;LI Baiqing;XU Tao;WANG Hongtao

作者机构：蚌埠医学院慢性疾病免疫学基础与临床安徽省重点实验室蚌埠233030 蚌埠医学院免疫学教研室蚌埠233030 蚌埠医学院临床检验诊断学教研室蚌埠233030 

基　　金：安徽省自然科学基金项目(1908085MH252 2008085QH405) 

出 版 物：《生命的化学》 (Chemistry of Life)

年 卷 期：2021年第41卷第12期

页      码：2686-2694页

摘      要：从NCBI中获得PPE7蛋白的编码基因序列,设计引物从H37Rv基因组中克隆出Rv0354c基因,将其转化到大肠杆菌感受态细胞DH5α中,扩大培养后测序鉴定。同时,运用ORF Finder、BLAST、Protparam、ProtScaleon Expasy、TMHMM Server v.2.0、SignalP4.1 Server、NetPhos3.1 Server、NetAcet1.0 Server、NetNGlyc1.0 Server、SOPMA、SWISS-MODEL、ABCpred、STRING等生物信息学分析工具对PPE7蛋白可能的相关生物学信息进行预测。结果显示,Rv0354c基因成功扩增,测序正确。基因全长426 bp,有2个开放阅读框,其编码蛋白为PPE7,由141个氨基酸组成,等电点为5.45,为疏水性蛋白,跨膜氨基酸数为0.59727,无信号肽、乙酰化位点和N-糖基化位点,有14个磷酸化位点;并且PPE7具有潜在的T、B细胞表位,与多种蛋白质存在相互作用关系,可能为抗结核疫苗的研发提供重要参考。

主 题 词：PPE7蛋白 结核分枝杆菌 Rv0354c 生物信息学分析 

学科分类：1007[医学-药学类] 100705[100705] 1001[医学-基础医学] 100103[100103] 10[医学] 

D　O　I：10.13488/j.smhx.20210529

馆 藏 号：203107173...