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基于16S rRNA基因对濒危脊椎动物鉴定的可行性

基于16S rRNA基因对濒危脊椎动物鉴定的可行性

作     者:蒋晓霞 徐博文 李伟刚 邵建宏 周傲白雪 唐泰山 赵福振 苗丽 黄海超 罗宝正 JIANG Xiaoxia;XU Bowen;LI Weigang;SHAO Jianhong;ZHOU Aobaixue;TANG Taishan;ZHAO Fuzhen;MIAO Li;HUANG Haichao;LUO Baozheng

作者机构:拱北海关技术中心珠海519001 南京海关动植物与食品检测中心南京210019 郑州海关技术中心郑州450003 

基  金:中华人民共和国海关总署科研项目(2019HK022) 

出 版 物:《野生动物学报》 (CHINESE JOURNAL OF WILDLIFE)

年 卷 期:2022年第43卷第1期

页      码:51-57页

摘      要:为探索16S rRNA基因条形码技术在濒危脊椎动物物种鉴定中的可行性,选取脊椎动物线粒体16S rRNA基因中长度为286 bp的片段设计通用引物,以哺乳纲(Mammalia)、爬行纲(Reptilia)、两栖纲(Amphibia)、软骨鱼纲(Chondrichthyes)和辐鳍鱼纲(Actinopterygii)中24科、28属、40种共71个濒危脊椎动物样本为研究对象,进行PCR扩增并对扩增产物进行纯化、测序和基因序列分析。结果显示:建立的检测方法灵敏度可以达0.001 ng/μL,其中62个(39个物种)样本扩增成功,57个样本(34个物种)测序结果与GenBank数据库中的参考序列具有较高相似度,可以鉴定到种的水平。测序所得的基因序列与参考序列的种内遗传距离为0~0.5%、种间遗传距离为1.0%~39.9%,最小种间遗传距离大于最大种内遗传距离,即存在明显的条形码间隔;另外5个样本(5个物种)测序结果在属内种间高度一致,只能鉴定到属的水平。基于16S rRNA基因片段构建的条形码可对濒危脊椎动物进行种属鉴定,可为濒危物种保护、打击非法走私等提供技术支撑。

主 题 词:濒危脊椎动物 16S rRNA 种属鉴定 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 0905[农学-林学类] 09[农学] 071007[071007] 090501[090501] 

D O I:10.19711/j.cnki.issn2310-1490.2022.01.037

馆 藏 号:203107285...

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