一种优化的胡杨高效多重(12重)SSR体系(英文)

作     者：徐放 赵舒 邬荣领 杜芳 XU Fang;ZHAO Shu;WU Rong-Ling;DU Fang

作者机构：北京林业大学计算生物学中心林木遗传育种国家工程实验室生物科学与技术学院北京100083 

基　　金：Doctoral Program of Higher Education of China (2011DD14120014) Fundamental Research Funds for the Central Universities (TD 2012-01) to FKD 

出 版 物：《植物分类与资源学报》 (Plant Diversity)

年 卷 期：2014年第36卷第3期

页      码：365-374页

摘      要：微卫星多重PCR方法是一种非常经济并且高通量的基因分型技术。本研究在耐干旱、盐碱的胡杨(Populus euphratica)中开发出一套荧光标记的12重微卫星工作体系。该体系包含12条表达序列标签微卫星(EST-SSR)引物,其中3条设计于NCBI,另外9条设计于二代的转录组序列。利用该多重微卫星体系可在单一的PCR反应体系中成功扩增出12条表达序列标签的微卫星短序列片段,并在胡杨的3个自然居群96个个体中对该体系进行了验证,结果显示该体系具有很高的稳定性及多样性。同时,在杨属的5个派7个种中对其通用性进行了检验,显示这些引物具有很高的通用性,成功扩增率为79%。本研究中提供的12重多重PCR结合本实验已经公开发表的2个8重体系对揭示胡杨及其他杨树的进化历史具有重要的作用。最后,本研究认为引物的选择,扩增效率,哑等位基因的检测是多重体系开发过程中最为关键的步骤。

主 题 词：胡杨 多重PCR 基因分型 

学科分类：0907[农学-草药学] 08[工学] 0829[工学-安全科学与工程类] 09[农学] 

D　O　I：10.7677/ynzwyj201413151

馆 藏 号：203107363...