中介蝮毒腺C-型凝集素样蛋白基因的cDNA克隆和序列分析

作     者：陈毓 张卫柱 刘玲玲 杨玉娥 杨章民 Chen Yu;Zhang Weizhu;Liu Lingling;Yang Yu'e;Yang Zhangmin

作者机构：陕西师范大学生命科学学院西安710119 西安回天血液制品有限责任公司西安710075 

基　　金：国家自然科学基金(30870303) 中央高校基本科研业务费专项资金(GK200902029) 国家大学生创新训练计划项目(201310718051)共同资助 

出 版 物：《基因组学与应用生物学》 (Genomics and Applied Biology)

年 卷 期：2015年第34卷第6期

页      码：1129-1136页

摘      要：C-型凝集素样蛋白是一类钙离子依赖型的具有糖结合活性的非酶蛋白,可结合凝血因子及血小板而影响人体的凝血系统稳态,具有抗凝作用。本研究基于中介蝮(Gloydius intermedius)蛇毒C-型凝集素样蛋白α链和β链的部分核苷酸序列,设计了2对PCR引物,通过RT-PCR技术从中介蝮毒腺中克隆出的α和β链(Gi-CTLPα,Gi-CTLPβ)的全长c DNA,克隆入T载体后,对所获克隆进行了测序,并进行了生物信息学分析。结果表明,Gi-CTLPα、Gi-CTLPβ的开放阅读框(ORF)分别为477 bp和462 bp,分别编码158个和153个氨基酸,信号肽分别为21个和23个氨基酸。蛋白质一级结构同源性分析表明,Gi-CTLPα和Gi-CTLPβ之间的序列相似度为29%,Gi-CTLPα和β分别与日本蝮(Gloydius blomhoffi)的Mamushiginα亚基和β亚基的同源性最高(90%和93%),Gi-CTLPα和Mamushigin的α亚基氨基酸序列的差异主要有13个,Gi-CTLPβ和Mamushigin的β亚基氨基酸序列的差异主要有7个。用蛋白功能预测软件SIFT在线分析表明,Gi-CTLPα中第47和136位的氨基酸差异使得Gi-CTLPα与Mamushiginα的功能明显不同,而Gi-CTLPβ和Mamushiginβ亚基的功能没有明显差异。由于Gi-CTLPα和β链会像Mamushigin那样通过二硫键形成异二聚体,这些一级结构的差异会影响其与靶蛋白的结合特性,这一结果为下一步研究Gi-CTLP的功能及利用奠定了理论基础。

主 题 词：中介蝮 蛇毒C-型凝集素样蛋白 cDNA 克隆 生物信息学 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

核心收录：

D　O　I：10.13417/j.gab.034.001129

馆 藏 号：203107890...