基于悬铃木转录组测序的SSR分子标记开发及鉴定

作     者：张思思 姚军 尹秋 聂超仁 王建强 Zhang Sisi;Yao Jun;Yin Qiu;Nie Chaoren;Wang Jianqiang

作者机构：武汉市园林科学研究院武汉430081 

基　　金：湖北省武汉市园林和林业局科技计划项目(WHGF2019A05)资助 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2022年第20卷第3期

页      码：919-925页

摘      要：悬铃木为悬铃木科(Platanaceae)悬铃木属(Platanus)植物的统称,本研究利用MISA软件对二球悬铃木(Platanus acerifolia)转录组测序获得的47 161条Unigene进行了SSR位点搜索及特征分析,结果发现SSR位点15 262个,SSR的出现频率为32.36%,SSR的平均距离为3.94 kb。其中单核苷酸重复所占比例最高,占总SSR位点的42.65%,其次是二核苷酸和三核苷酸重复类型,分别占34.17%和21.27%。本研究使用Primer 3软件对二球悬铃木转录组测序得到的15 262个SSR位点分别设计3对引物,筛选60对引物进行扩增验证,其中46对引物扩增获得预期条带。以10个悬铃木无性系为材料,发现其中7对引物的扩增产物表现出多态性。以上结果表明,基于悬铃木转录组序列的SSR标记开发切实可行,本研究开发的SSR标记可用于悬铃木种群遗传多样性检测和种间亲缘关系鉴定。

主 题 词：悬铃木 转录组 SSR 引物 

学科分类：0907[农学-草药学] 08[工学] 0829[工学-安全科学与工程类] 09[农学] 

D　O　I：10.13271/j.mpb.020.000919

馆 藏 号：203108260...