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正交设计优化广藿香基因组SRAP扩增体系的研究

正交设计优化广藿香基因组SRAP扩增体系的研究

作     者:吴友根 郭巧生 何际婵 林尤奋 

作者机构:南京农业大学中药材研究所江苏南京210095 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所海南儋州571737 热带园艺植物资源与遗传改良教育部重点实验室/海南大学园艺园林学院海南海口570228 

基  金:国家自然科学基金(编号:30960533) 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(编号:PZS053) 海南省自然科学基金(编号:310022) 海南省教育厅高等学校科学研究项目(编号:Hjkj2009-25) 海南大学科研项目(编号:hd09xm58) 海南大学科研启动基金(编号:kyqd1002) 

出 版 物:《江苏农业科学》 (Jiangsu Agricultural Sciences)

年 卷 期:2010年第38卷第4期

页      码:18-21页

摘      要:以改良CTAB法提取的广藿香叶片DNA为模板,采用正交试验设计,从Mg2+、dNTP、引物浓度和DNA聚合酶4因素3水平,对SRAP扩增效果进行研究,比较不同模板DNA浓度对PCR扩增的影响,确立适合广藿香SRAP-PCR反应的最佳体系。利用SRAP-PCR优化体系对引物进行了全面筛选。结果表明:各因素不同水平浓度对PCR反应结果均有显著影响,总体积20μL的SRAP-PCR优化反应体系中含有:2μL 10×buffer、20 ng模板DNA、1.5 mmol/L Mg2+、250μmol/L dNTP、0.3μmol/L Primer、TaqDNA聚合酶1.5 U。运用该体系对部分广藿香单株进行检验,证明该体系稳定可靠;以此体系为基础从90对引物中共筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的SRAP引物18对。

主 题 词:广藿香 SRAP标记 正交试验 体系优化 

学科分类:1008[医学-中药学类] 10[医学] 

D O I:10.3969/j.issn.1002-1302.2010.04.006

馆 藏 号:203108724...

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