暴马丁香的叶绿体基因组特征分析

作     者：王久利 郑旭 邓因子 WANG Jiuli;ZHENG Xu;DENG Yinzi

作者机构：青海省特色经济植物高值化利用重点实验室青海西宁810007 青海民族大学生态环境与资源学院青海西宁810007 

基　　金：青海民族大学高层次人才项目(2021XJG17) 青海省科技厅自然科学基金项目(2019-ZJ-976Q)资助 

出 版 物：《阜阳师范大学学报（自然科学版）》 (Journal of Fuyang Normal University:Natural Science)

年 卷 期：2022年第39卷第1期

页      码：55-64页

摘      要：为了解暴马丁香的叶绿体基因组的特征,本研究分析该叶绿体基因组结构和基因构成特征,并进行系统演化基因组分析。结果表明:(1)暴马丁香叶绿体基因组的功能基因有132个,其中包括8个rRNA基因,36个tRNA基因和88个蛋白编码基因。(2)在暴马丁香叶绿体基因组的密码子组成中,RSCU值>1的密码子有30个,其中以A/U碱基结尾的有27个;RSCU值<1的密码子有32个,其中以G/C碱基结尾的的密码子偏多,为29个。(3)在暴马丁香的叶绿体基因组中,检测出106个散在重复序列,包括61个正向重复序列和45个回文重复序列;检测到218个SSR位点,为其中211个位点成功设计出PCR引物。(4)通过邻接法(NJ)对暴马丁香及暴马丁香之外的42种木犀科植物的叶绿体基因组构建系统发育树,结果显示:暴马丁香与丁香属植物北京丁香的亲缘关系最近。本研究为系统演化和种质资源的鉴定等研究奠定理论基础,同时为暴马丁香的保护遗传学和资源开发利用等研究提供科学依据。

主 题 词：暴马丁香 叶绿体基因组 散在重复序列 密码子偏好性 系统发育分析 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 090102[090102] 

D　O　I：10.14096/j.cnki.cn34-1069/n/2096-9341(2022)01-0055-10

馆 藏 号：203109425...