芥菜种子颜色调控基因TT8的等位变异及其地理分布分析

作     者：张钰坤 陆赢 崔看 夏石头 刘忠松 ZHANG Yu-Kun;LU Ying;CUI Kan;XIA Shi-Tou;LIU Zhong-Song

作者机构：湖南农业大学农学院/作物基因工程湖南省重点实验室湖南长沙410128 国家油料作物改良中心湖南分中心湖南长沙410128 湖南农业大学生物科学技术学院湖南长沙410128 

基　　金：国家自然科学基金项目(U20A2029)资助 

出 版 物：《作物学报》 (Acta Agronomica Sinica)

年 卷 期：2022年第48卷第6期

页      码：1325-1332页

摘      要：在芸薹属植物中TT8基因是种子颜色的调控基因。异源四倍体芥菜TT8基因有2个拷贝,分别位于A09与B08染色体上。本研究针对不同拷贝设计特异引物,对749份芥菜进行扩增、测序或酶切检测,发现***8和***8各有7个和6个等位变异。与野生型相比, ***8.a1-a5和***8.b1-b4等位基因都发生了大片段插入,而***8.a6出现了删除,但***8.b5仅在第7外显子处有1个碱基替换。使用Repeatmasker软件对等位基因序列与甘蓝型油菜注释库进行重复序列比对,发现***8.a1-a4和***8.b1-b4等位基因主要含有Ⅰ类转座子,少量为Ⅱ类转座子及Helitron类转座子插入。统计还发现, ***8.b5单倍型为主要的黄籽单倍型,占所分析黄籽材料的89.49%(247/276),其次为***8.b3单倍型,占6.52%。地理分布分析结果显示,中国尤其是新疆芥菜黄籽突变等位基因频率显著高于世界其他地区,这与历史记载相印证,说明芥菜黄籽性状可能起源于中国新疆。本研究结果为油菜黄籽育种选用优异基因资源提供了依据。

主 题 词：芥菜 黄籽 TT8 等位变异 转座子 种质资源 地理分布 

学科分类：09[农学] 0901[农学-植物生产类] 

核心收录：

D　O　I：10.3724/SP.J.1006.2022.14072

馆 藏 号：203109690...