先天性心脏病有关的风疹病毒Oligo探针与功能基因芯片的设计

作     者：莫小阳 马文丽 张亚莉 赵海全 郑文岭 MO Xiao-yang;MA Wen-li;ZHANG Ya-li;ZHAO Hai-quan;ZHENG Wen-ling

作者机构：湖南师范大学生命科学院心脏发育研究中心 

基　　金：广东省生物芯片重点实验室启动基金资助项目 湖南师范大学青年科学基金资助项目(050634) 

出 版 物：《心脏杂志》 (Chinese Heart Journal)

年 卷 期：2006年第18卷第6期

页      码：632-635页

摘      要：目的风疹病毒(Rubella virus,RV)是先天性风疹综合征(先天性心脏病、先天性白内障和耳聋的三联综合征)的致病因素,本研究针对RV全基因组序列的生物信息学特点,设计RV 60-m er长链寡核苷酸探针,探讨寡核苷酸探针和功能基因芯片的设计方法。方法利用生物信息学软件Array Designer 2.0针对RV全基因组设计Tm值相近、长度均一的60-m er探针,利用其BLAST功能将所得探针在GenBank数据库进行序列比对分析,筛选得到RV特异性O ligo探针并设计成功能基因芯片。结果获得11条60-m er O ligo探针,用于打印成DNA芯片,拟用于RV检测与病毒基因表达功能分析。结论利用Array Designer 2.0软件设计芯片探针比常见其他方法更有效,尤其适合于病毒检测和病毒基因功能分析复合型芯片的设计。

主 题 词：风疹病毒 功能基因芯片 Oligo探针 先天性心脏病 

学科分类：1007[医学-药学类] 100705[100705] 1002[医学-临床医学类] 1001[医学-基础医学] 100201[100201] 100103[100103] 10[医学] 

D　O　I：10.13191/j.chj.2006.06.32.moxy.010

馆 藏 号：203110125...