四种基因甲基化特异性PCR引物设计探讨

作     者：林江 姚冬明 钱军 许文荣 钱震 朱照辉 陈芹 王雅丽 肖高飞 LIN Jiang;YAO Dong-ming;QIAN Jun;XU Wen-rong;QIAN Zhen;ZHU Zhao-hui;CHEN Qin;WANG Ya-li;XIAO Gao-fei

作者机构：江苏大学附属人民医院中心实验室江苏镇江212002 江苏大学附属人民医院血液科江苏镇江212002 江苏大学基础医学与医学技术学院江苏镇江212013 

基　　金：江苏省自然科学基金资助项目(BK2009206) 江苏省医学重点人才资助项目(RC2007035) 镇江市社会发展基金资助项目(SH2006032) 

出 版 物：《江苏大学学报（医学版）》 (Journal of Jiangsu University：Medicine Edition)

年 卷 期：2009年第19卷第6期

页      码：461-464页

摘      要：目的:对甲基化特异性PCR(methylation-specific PCR,MSP)引物设计进行探讨。方法:使用Methyl PrimerExpress Software Version 1.0软件、"methprimer"和"MSPprimer"的网上在线软件设计的引物以及参照国外文献的MSP引物对CCAAT/增强子结合蛋白ζ(CEBPζ),CCAAT/增强子结合蛋白δ(CEBPδ)、脆性组氨酸三联体(FHIT)和死亡相关蛋白激酶(DAPK)基因启动子进行MSP扩增,然后对其MSP产物进行测序验证以比较MSP引物设计的可靠性。结果:对于CEBPζ,CEBPδ,FHIT和DAPK启动子基因所设计的MSP引物经MSP后均获得了所需要的目的条带,但经测序鉴定Methyl Primer Express和methprimer设计的CEBPδ,CEBPζ-1的MSP扩增产物为假阳性产物,而MSPprimer设计的CEBPζ-2的MSP产物为正确序列。结论:MSP引物设计的质量是保证MSP扩增成功的关键因素。

主 题 词：甲基化特异性PCR 引物 设计 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 071010[071010] 081704[081704] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-轻工类] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1671-7783.2009.06.001

馆 藏 号：203110237...