广西茶树地方品种遗传多样性和遗传结构的EST-SSR分析

作     者：周炎花 乔小燕 马春雷 乔婷婷 金基强 姚明哲 陈亮 Zhou Yanhua;Qiao Xiaoyan;Ma Chunlei;Qiao Tingting;Jin Jiqiang;Yao Mingzhe;Chen Liang

作者机构：中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心杭州310008 漳州天福茶职业技术学院漳州363202 广东省农业科学院茶叶研究所广州510640 

基　　金：国家"863"计划(2006AA10Z171) 国家茶叶产业技术体系(nycytx-026) 国家自然科学基金(30901159) "十一五"国家科技支撑计划(2006BAD13B06) 公益性行业(农业)科研专项(3-35) 浙江省自然科学基金(Y3090041 Y3100291) 

出 版 物：《林业科学》 (Scientia Silvae Sinicae)

年 卷 期：2011年第47卷第3期

页      码：59-67页

摘      要：利用设计合成的60对扩增稳定的EST-SSR核心引物分析51份广西茶树地方品种的遗传多样性和遗传结构,共检测到232个等位基因,每对引物检测到2～7个,平均3.88个。群体的观测杂合度(Ho)变化范围为0.02(TM149)～0.92(TM186),平均为0.37;期望杂合度(He)的变化范围为0.13(TM144,TM147)～0.73(TM189),平均为0.47;位点的多态信息含量(PIC)介于0.12～0.68之间,平均为0.41。地区间遗传相似系数在0.83～0.94之间,说明不同地区地方品种间的亲缘关系较近。对于茶与白毛茶群体而言,平均遗传分化系数为0.02(P<0.001),即有2%的遗传变异存在于群体间,而有98%的遗传变异存在于群体内。另外,种群内的近交系数Fis平均为0.21,说明群体内近交现象较严重。基于Nei’s遗传距离,利用PowerMarker3.25软件进行Neighbor-Joining聚类分析,将51份地方品种聚为3类:桂林、来宾和贺州的大部分品种,钦州和梧州的全部品种聚在第Ⅰ类;第Ⅱ类包含多数地区的品种;第Ⅲ类主要由崇左、防城港和南宁的品种组成。该结果与基于模型的遗传结构分析结果基本一致。

主 题 词：茶树 遗传多样性 遗传结构 EST-SSR 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 090701[090701] 0907[农学-草药学] 07[理学] 09[农学] 071007[071007] 

核心收录：

馆 藏 号：203110504...