2019-2020年湖北部分地区G9P[8]型人轮状病毒基因特征

作     者：杨立君 陈月 米文琴 唐一通 范久波 王媛 廖诗英 陈焕春 何启盖 江云波 YANG Li-jun;CHEN Yue;MI Wen-qin;TANG Yi-tong;FAN Jiu-bo;WANG Yuan;LIAO Shi-ying;CHEN Huan-chun;HE Qi-gai;JIANG Yun-bo

作者机构：华中农业大学动物医学院农业微生物学国家重点实验室武汉430070 湖北文理学院医学部武汉430070 

基　　金：中央高校基本科研业务费专项基金资助(No.2662019YJ005) 国家现代产业技术体系(No.CARS-35)联合资助 

出 版 物：《中国人兽共患病学报》 (Chinese Journal of Zoonoses)

年 卷 期：2022年第38卷第4期

页      码：359-365页

摘      要：目的对人A组轮状病毒进行检测及分离鉴定,并研究其各基因片段的遗传进化关系。方法2019-2020年对湖北武汉市和襄阳市临床腹泻病人的粪便样品进行采集,共319份。设计特异性轮状病毒VP6基因引物,RT-PCR检测轮状病毒的感染情况。将阳性样品接种于MA104细胞进行轮状病毒的分离。RT-PCR特异性扩增VP6基因和特异性间接免疫荧光对其进行病毒鉴定及病毒增殖检测;并进一步通过RT-PCR扩增轮状病毒的11个基因片段,在线工具Rota C V2.0对测序结果进行分型分析。Mega软件对其全基因组序列进行遗传进化分析。结果轮状病毒感染阳性标本共69份,阳性率为21.63%。成功分离获得11株人轮状病毒,主要衣壳蛋白VP7和VP4基因型均为G9P[8]型。其中3株轮状病毒归属于类Wa株毒株,基因型图谱为G9-P[8]-I1-R1-C1-M1-A1-N1-T1-E1-H1。8株毒株在Wa-like的基因型中具有DS-1-like的NSP4为E2基因型特征。基因型图谱为G9-P[8]-I1-R1-C1-M1-A1-N1-T1-E2-H1。结论G9P[8]型人轮状病毒毒株在2019-2020年湖北部分地区占主导趋势,且其NSP4基因以E2基因型为主要流行形式。

主 题 词：轮状病毒 分离鉴定 基因型 遗传进化分析 

学科分类：1007[医学-药学类] 100705[100705] 1001[医学-基础医学] 100103[100103] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.3969/j.issn.1002-2694.2022.00.040

馆 藏 号：203110507...