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μ-calpain激活因子UK114的克隆与序列分析

μ-calpain激活因子UK114的克隆与序列分析

作     者:常泓 南庆贤 岳文斌 CHANG Hong;NAN Qing-xian;YUE Wen-bin

作者机构:山西农业大学生命科学学院太谷030801 中国农业大学食品学院北京100083 山西农业大学动物科技学院太谷030801 

基  金:国家自然科学基金资助项目(30271003) 山西省科技攻关项目(011030) 山西省青年基金资助项目(20021038) 

出 版 物:《畜牧兽医学报》 (ACTA VETERINARIA ET ZOOTECHNICA SINICA)

年 卷 期:2006年第37卷第7期

页      码:629-634页

摘      要:构建了山羊肝脏cDNA文库,采用平板裂解法提取噬菌体DNA,以此为模板用所设计的引物以PCR法扩增出-μcalpain激活蛋白UK114基因,并克隆到pGEM-T easy载体。序列分析表明,UK114 cDNA包括起始密码子和终止密码子在内全长共计1 017 bp,5′非编码区长为39 bp,3′非编码区长为567 bp,编码区长411 bp,编码137个氨基酸序列。与GenBank中Colombo等所得UK114基因比较表明:在5′非编码区,UK114为102 bp,克隆的UK114为39 bp,且二者仅有9个核苷酸序列是相同的;紧接着是起始密码子ATG,然后是一个411 bp的阅读框(40 nt^450 nt),编码137个氨基酸,理论分子量约为15 ku,二者在编码区仅有1个bp不同,为无义突变;在3′非编码区为552 bp,所克隆的UK114为567 bp,二者在此区域有57个核苷酸序列是不同的:UK114为polyA,所克隆的是不同的核苷酸。二者的同源性为91%,突变的86个核苷酸中都为无义突变,开放阅读框中仅有一个核苷酸突变。

主 题 词:钙激活酶 UK114 克隆 序列分析 

学科分类:0905[农学-林学类] 09[农学] 090501[090501] 

核心收录:

D O I:10.3321/j.issn:0366-6964.2006.07.001

馆 藏 号:203111647...

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