椰子油对育成猪肝脏转录组高通量测序的影响

作     者：李建平 秦贵信 张巧灵 赵志辉 王大力 孙博兴 姜海龙 LI Jian-ping;QIN Gui-xin;ZHANG Qiao-ling;ZHAO Zhi-hui;WANG Da-li;SUN Bo-xing;JIANG Hai-long

作者机构：吉林农业大学动物科学技术学院吉林长春130118 河南牧业经济学院动物科技学院河南郑州450011 吉林大学动物医学学院吉林长春130062 吉林大学农业试验基地吉林长春130062 

基　　金：吉林省安全优质肉猪现代生产关键技术示范(20140301013ny) 国家科技支撑计划课题(2012bad39b03) 

出 版 物：《中国畜牧杂志》 (Chinese Journal of Animal Science)

年 卷 期：2016年第52卷第5期

页      码：60-65页

摘      要：试验设计了椰子油组和对照组2个处理。采集育成猪肝脏组织,进行转录组高通量测序,找出2种处理间的差异表达基因及差异代谢通路。利用Illumina Hi SeqTM2 500高通量RNA-seq测序技术测序,使用Top Hat2软件将测序得到的reads序列与猪参考基因组(Sscrofa10.2)序列比对,找出差异表达基因,并在Nr、GO和KEGG数据库中进行功能注释、富集分析和聚类分析。结果表明:椰子油组和对照组肝脏中差异表达基因共有487个,与对照组相比,椰子油组表达上调的基因有222个,下调的基因有265个。在差异表达上/下调前15位基因中,有多个基因是参考基因组中没有的新基因和功能未知基因。GO功能分类注释到细胞组成、分子功能和生物学过程数据库中的差异表达基因数分别有398、368个和398个;注释到KEGG通路中差异表达基因数188个。

主 题 词：椰子油 高通量RNA测序 差异表达基因 肝脏 育成猪 

学科分类：090502[090502] 0905[农学-林学类] 09[农学] 

D　O　I：10.3969/j.issn.0258-7033.2016.05.013

馆 藏 号：203112058...