枯草芽孢杆菌脂肪酶LipA的生物信息学分析

作     者：黎菁菁 赖昕珏 李鑫尧 马俊炜 余铭怡 罗佳伟 陈胤熹 余洁婷 郑少鹏 郑敦锦 曹诗林 陈宛涓 LI Jingjing;LAI Xinjue;LI Xinyao;MA Junwei;YU Minyi;LUO Jiawei;CHEN Yinxi;YU Jieting;ZHENG Shaopeng;ZHENG Dunjin;CAO Shilin;CHEN Wanjuan

作者机构：佛山科学技术学院广东省食品智能制造重点实验室广东佛山528000 佛山科学技术学院食品科学与工程学院广东佛山528000 佛山科学技术学院材料科学与氢能学院广东佛山528000 

基　　金：广东省基础与应用基础研究基金佛山市联合基金(粤佛联合基金)青年基金项目(2019A1515110621 2019A1515111049) 广东普通高校青年创新人才项目(自然科学类)(2017KQNCX217) 佛山科学技术学院高层次人才启动项目(GG07016) 广东省科技创新战略专项资金项目(pdjh2020b0627 pdjh2022b0550) 佛山科学技术学院实验室开放创新基金(2022 No.005) 

出 版 物：《现代食品科技》 (Modern Food Science and Technology)

年 卷 期：2022年第38卷第7期

页      码：113-119,10页

摘      要：该研究应用生物信息学方法对枯草芽孢杆菌脂肪酶LipA进行分析,旨在为LipA的后续研究奠定一定的理论基础。采用一系列在线网站或软件对LipA的一级结构、亲疏水性、基本特性、二级结构、特殊卷曲螺旋、模体以及富含脯氨酸(P)、谷氨酸(E)、丝氨酸(S)和苏氨酸(T)的PEST序列等进行预测和分析,并对三级结构进行同源建模,对其表面电位、可及性分布以及Ramachandran图等进行分析。枯草芽孢杆菌脂肪酶LipA是一种由212个氨基酸组成的稳定的脂溶性蛋白质,其亲、疏水性最强的区域分别为Lys75~Asn81和Val9~Leu17;不存在稳定的二聚体、三聚体卷曲螺旋和非PEST序列;有3种可能参与不同的生化反应的模体;有5段α-螺旋、6段β-折叠的α/β类蛋白;整体呈弱正电势;LipA的可及性和Ramachandran图表明建模得到的三维结构是合理、可靠的。该研究为后续对枯草芽孢杆菌脂肪酶LipA的分子设计和改造提供了一定的理论基础。

主 题 词：枯草芽孢杆菌脂肪酶LipA 生物信息学 同源建模 

学科分类：0832[0832] 08[工学] 083201[083201] 

D　O　I：10.13982/j.mfst.1673-9078.2022.7.1130

馆 藏 号：203113618...