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基于线粒体COⅠ基因的9个青鱼群体遗传变异分析

基于线粒体COⅠ基因的9个青鱼群体遗传变异分析

作     者:鲍生成 包天杰 王沈同 徐晓雁 代雅凡 张家华 李家乐 沈玉帮 BAO Sheng-Cheng;BAO Tian-Jie;WANG Shen-Tong;XU Xiao-Yan;DAI Ya-Fan;ZHANG Jia-Hua;LI Jia-Le;SHEN Yu-Bang

作者机构:上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 上海海洋大学上海水产养殖工程技术研究中心上海201306 

基  金:国家现代农业产业技术体系资助(CARS-45-03) 

出 版 物:《水生生物学报》 (Acta Hydrobiologica Sinica)

年 卷 期:2022年第46卷第7期

页      码:933-938页

摘      要:为掌握中国青鱼(Mylopharyngodon piceus)种质资源分布特征,揭示青鱼种质资源的遗传变异情况,研究通过对9个青鱼群体271个样本线粒体COⅠ区设计引物并进行PCR扩增,运用软件分析了群体内部遗传多样性和各群体之间的进化关系。分析结果表明:长度为1003 bp的9个群体COⅠ基因区域序列GC含量低于AT含量,共检测到6个突变位点,7种单倍型,其中Hap4单倍型在9个群体中都有分布。AMOVA分子方差分析显示271个青鱼样本的变异90.33%来自群体内部,9.67%来自群体间。青鱼总体核苷酸多样性(π)偏低,在0.00109—0.00244。单倍型多样(H_(d))性较高,在0.403—0.847。遗传分化系数(F_(st))在–0.0033—0.23445,保持在低度至高度分化,主要集中在低度和中度分化。分析得到广东佛山群体可能经历过瓶颈效应,其余8个群体可能经历过快速的种群扩张事件。研究结果揭示了中国目前青鱼种质资源的遗传背景,可以为中国青鱼种质资源的保护和创新利用提供重要的参考依据。

主 题 词:COⅠ基因 地理群体 遗传多样性 遗传分化 青鱼 

学科分类:07[理学] 0713[0713] 

核心收录:

D O I:10.7541/2022.2021.0162

馆 藏 号:203113626...

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