基于openEHR的医疗过程数据抽取与转换软件设计实现

作     者：徐海峰 毛华坚 杨雨 李梅 赵东升 XU Haifeng;MAO Huajian;YANG Yu;LI Mei;ZHAO Dongsheng

作者机构：军事医学研究院科研保障中心北京100850 新疆军区总医院信息科乌鲁木齐830000 国家卒中数据中心北京100101 

基　　金：国家自然科学基金(71532014) 国防创新特区项目(19-163-12-ZT-006-004-01)资助 

出 版 物：《北京生物医学工程》 (Beijing Biomedical Engineering)

年 卷 期：2022年第41卷第4期

页      码：390-398页

摘      要：目的随着医疗数据的快速增长,过程挖掘成为一个新的研究热点。然而目前缺乏能够直接用于医疗过程挖掘的数据抽取工具,为此课题组开发了基于openEHR原型查询语言(archetype query language,AQL)的数据抽取软件,支持从兼容openEHR标准的医疗信息系统中提取事件日志,便于临床科研人员进行过程挖掘与分析。方法首先,对openEHR的元数据进行预处理,解析原型(archetype)和模板(template)文件,确定其中每个数据项的对应关系;其次,通过WordNet字典进行查询扩展,得到用户输入的同义词列表;然后,根据用户选择的数据项和设置的检索条件,自动生成原型查询语言脚本;最后,在电子病历服务器上运行AQL脚本提取出所需数据,并转换为过程挖掘所使用的标准事件日志格式(extensible event stream,XES)。结果本文以国家卫生健康委员会脑卒中防治工程委员会卒中院内筛查项目为例,将临床研究中3种常用的数据检索类型作为评价指标,对软件功能进行了验证。在输入查询条件后,软件能够自动生成和执行AQL脚本,并正确返回转换后的日志文件。结论本文开发的软件为临床科研人员提供了一种易用的医疗过程数据获取工具,它能够有效屏蔽异构信息系统的复杂性,便于开展医疗过程挖掘的分析与研究工作。

主 题 词：openEHR 原型查询语言 过程挖掘 事件日志 临床数据检索 

学科分类：0831[工学-公安技术类] 08[工学] 0836[0836] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1002-3208.2022.04.009.

馆 藏 号：203113904...